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明-明-金虫 (小有名气)
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[求助]
cif文件中的原子电荷分配已有2人参与
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我在数据库中找到了伊利石的cif文件,导入MS后,先点击calculate bonds,每个原子的电荷为零,然后没有进行手动分配电荷,构建超胞后,根据文献,采用UFF力场,Qeq算法来对其进行优化,然后就出现报错了。 This periodic system bears a net charge (-64.000000e) and the QEq calculation cannot be performed. This periodic system bears a net charge (-64.000000e) and the QEq calculation cannot be performed. Unable to calculate energy and gradients. Geometry optimization finished with an error condition. 查看报错后的晶体文件,每个原子的力场类型都分配了,但是charge还是为零,用compass力场就不会出现这种现象,优化后原子的电荷、力场均分配了。但查文献,一般是用UFF+Qeq来进行优化以及后续的吸附计算,请问这是什么原因?新人求助。。。是找来的cif文件构建晶体模型时都必须先手动分配原子电荷信息吗? |
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