24小时热门版块排行榜    

查看: 327  |  回复: 4
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 cohnii 的 2 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cohnii

银虫 (小有名气)

[交流] 请问关于blast

我在做菌种鉴定,18S序列已经测出来,准备在NCBI的数据库上进行blast,但是好像有很多个数据库要选,不知道选哪个合适,因为出来的结果都非常的多。有没有人可以指点一下?一般用18S比对鉴定菌种是,都选哪数据库呢?谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cohnii

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by chenjiong at 2008-9-13 10:58:
nucleotide blast  这个是核酸和核酸的之间的比较的。建议楼主用这个比较

是用的这块,进去之后,吧我的序列输入后,下面还有个选择数据库,例如:Nucleotide collection;NCBI genomes; sequence tagged sited; 等选项,要选哪个呢?
3楼2008-09-13 11:06:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

chenjiong

铁虫 (初入文坛)


cohnii(金币+1,VIP+0):
nucleotide blast  这个是核酸和核酸的之间的比较的。建议楼主用这个比较
2楼2008-09-13 10:58:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑漩涡

新虫 (著名写手)

collection   genome 是基因组'后面那个是序列标签位点.collection正解

[ Last edited by 微笑漩涡 on 2008-9-13 at 11:30 ]
4楼2008-09-13 11:29:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

anquren

金虫 (正式写手)

★ ★
cohnii(金币+2,VIP+0):
引用回帖:
Originally posted by cohnii at 2008-9-13 11:06:


是用的这块,进去之后,吧我的序列输入后,下面还有个选择数据库,例如:Nucleotide collection;NCBI genomes; sequence tagged sited; 等选项,要选哪个呢?

根据你的目的,应该选Nucleotide collection
5楼2008-09-13 11:37:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +15 医学老男孩 2026-08-20 18/900 2026-08-21 13:46 by 医学老男孩
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +23 yaoyewhu2008 2026-08-20 25/1250 2026-08-21 12:19 by Poppy1104
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 7/350 2026-08-21 12:15 by weiyin
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +15 archvillain 2026-08-15 27/1350 2026-08-21 11:32 by tim76
[基金申请] 科研孤儿太难了 +15 我4大白菜 2026-08-20 16/800 2026-08-21 11:07 by yming1319
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 13/650 2026-08-21 08:30 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +4 archvillain 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:10 by gatelove
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见