24小时热门版块排行榜    

查看: 322  |  回复: 4
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 cohnii 的 2 个金币

cohnii

银虫 (小有名气)

[交流] 请问关于blast

我在做菌种鉴定,18S序列已经测出来,准备在NCBI的数据库上进行blast,但是好像有很多个数据库要选,不知道选哪个合适,因为出来的结果都非常的多。有没有人可以指点一下?一般用18S比对鉴定菌种是,都选哪数据库呢?谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenjiong

铁虫 (初入文坛)


cohnii(金币+1,VIP+0):
nucleotide blast  这个是核酸和核酸的之间的比较的。建议楼主用这个比较
2楼2008-09-13 10:58:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cohnii

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by chenjiong at 2008-9-13 10:58:
nucleotide blast  这个是核酸和核酸的之间的比较的。建议楼主用这个比较

是用的这块,进去之后,吧我的序列输入后,下面还有个选择数据库,例如:Nucleotide collection;NCBI genomes; sequence tagged sited; 等选项,要选哪个呢?
3楼2008-09-13 11:06:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑漩涡

新虫 (著名写手)

collection   genome 是基因组'后面那个是序列标签位点.collection正解

[ Last edited by 微笑漩涡 on 2008-9-13 at 11:30 ]
4楼2008-09-13 11:29:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

anquren

金虫 (正式写手)

★ ★
cohnii(金币+2,VIP+0):
引用回帖:
Originally posted by cohnii at 2008-9-13 11:06:


是用的这块,进去之后,吧我的序列输入后,下面还有个选择数据库,例如:Nucleotide collection;NCBI genomes; sequence tagged sited; 等选项,要选哪个呢?

根据你的目的,应该选Nucleotide collection
5楼2008-09-13 11:37:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cohnii 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金啊基金 +3 longfie172 2026-08-20 3/150 2026-08-21 00:04 by wuchongjun
[基金申请] 科研孤儿太难了 +14 我4大白菜 2026-08-20 15/750 2026-08-20 22:33 by 袁向阳007
[基金申请] 让我中一个面上吧! +8 大萍1987 2026-08-20 10/500 2026-08-20 21:48 by 大萍1987
[基金申请] 言之凿凿,明天官网会通知放榜? +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见