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lylyly2006木虫 (正式写手)
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[交流]
关于构建载体移码问题 已有3人参与
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设计引物构建载体后测序,通过测序结果怎样去检测有没有移码问题,就是怎么看有没有导致后面的标签蛋白不能表达。例如我的顺序是启动子+基因+Myc标签蛋白,这个蛋白编码是从基因的atg开始,还是rbs。如果是标签蛋白+基因,这个基因还需要atg吗?怎么通过测序结果看有没有移码,有没有软件推荐 发自小木虫IOS客户端 |
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nono2009: 金币-20, 屏蔽内容, 违规存档, 禁止回帖广告 2015-10-25 09:57:37
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2楼2015-10-24 06:34:26
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无论标签在前在后,都是从启动子后面的kozak序列后的第一个atg开始的,至于融合表达的后面的基因的atg有没有都没有关系,没有任何影响。测序结果怎么看有没有移码,一般的序列分析软件都能做到。推荐国人做的BioXM,简单直观;或者DNAman,多序列比对功能非常强大。只需要对你的测序结果做一个ORF分析就好了,然后和你的目的基因的氨基酸序列对比,后者可手工加上标签翻译出来的氨基酸序列。以上。 发自小木虫Android客户端 |
3楼2015-10-24 11:34:38
lylyly2006
木虫 (正式写手)
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