应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 有关MS搜索过渡态的问题
171/2返回列表12下一页
查看: 3202  |  回复: 16
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

[交流] 有关MS搜索过渡态的问题

看到不少有关搜索过渡态的文章，用的方法是高斯和MS中Dmol3的方法，想来这两种方法应该还是大家比较认可的，但是现在有不少人开始用MS中CASTEP版块来搜索过渡态，我也不是太懂，就想让大伙儿讨论下：MS中的Dmol3版块和CASTEP版块，搜索过渡态的优缺点，还有我们是否可以结合这两种方法？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
知與誰同，與狼共舞。
1楼 2015-10-23 16:14:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
看你做什么样的过渡态了。

分子体系肯定Gaussian更合适，DMol3差不多只能使用GGA水平，精度自然很渣，就算使用杂化泛函，速度也相当缓慢，意思不大。

如果是表面体系，gaussian肯定是不能做的，DMol3计算几乎不依赖晶格大小，这样能够取一个充分的真空层，并且Dmol3可以优化过渡态，则不行，而且真空层取大了根本算不动。但castep的好处是，表面如果含有金属原子，并且必须使用DFT+U方式才能够得到定性正确的情况下，dmol3就没辙了。不涉及这个问题，推荐还是使用DMol3。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

清华粉体
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
5楼2015-10-24 10:38:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
9楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-10-26 16:09:09
也不一定，要看哪些金属原子，而且DFT+U也并非所有体系都有改善，杂化泛函能好一些，但计算量颇大。...

假如体系中含有Fe原子是需要+U的方法吧，还有就是关于这个杂化泛函，是在设置中选择不同的泛函还是在计算性质中加入泛函？
赞一下(1人) 回复此楼
知與誰同，與狼共舞。
10楼2015-10-26 18:16:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

zhenwuhuang

至尊木虫 (文学泰斗)
blessing in the last quarter of year 2015 ! ~~~~~~~~~~~~~
赞一下 回复此楼
2楼2015-10-23 16:45:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DJBLOVEMY

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你可以看看教程，上面都有

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2015-10-23 16:52:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tyut sunwei

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
Dmol3的精度比较高，tcastep能做赝势，但那个不可以

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
4楼2015-10-23 20:07:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
3楼: Originally posted by DJBLOVEMY at 2015-10-23 16:52:09
你可以看看教程，上面都有

具体是什么的教程，有这方面的比较吗？
赞一下 回复此楼
知與誰同，與狼共舞。
6楼2015-10-26 15:35:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
4楼: Originally posted by tyut sunwei at 2015-10-23 20:07:35
Dmol3的精度比较高，tcastep能做赝势，但那个不可以

想问的是它们的优缺点，castep是否也可以来研究过渡态，它的亮点是什么？
赞一下 回复此楼
知與誰同，與狼共舞。
7楼2015-10-26 15:36:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
5楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-10-24 10:38:46
看你做什么样的过渡态了。

分子体系肯定Gaussian更合适，DMol3差不多只能使用GGA水平，精度自然很渣，就算使用杂化泛函，速度也相当缓慢，意思不大。

如果是表面体系，gaussian肯定是不能做的，DMol3计算几乎 ...

谢谢！也就是说如果体系涉及到金属原子，就必须使用DFT+U的方法，才能准确的研究其过渡态？如果没用的话，是不准确的？
赞一下 回复此楼
知與誰同，與狼共舞。
8楼2015-10-26 15:38:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by pcczhouwei at 2015-10-26 15:38:13
谢谢！也就是说如果体系涉及到金属原子，就必须使用DFT+U的方法，才能准确的研究其过渡态？如果没用的话，是不准确的？...

也不一定，要看哪些金属原子，而且DFT+U也并非所有体系都有改善，杂化泛函能好一些，但计算量颇大。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
9楼2015-10-26 16:09:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pcczhouwei 的主题更新
171/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 6/300 2026-09-03 15:23 by T0rGB46095mJ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 9/450 2026-09-03 15:21 by T0rGB46095mJ
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 rFEsUBKXRll0 2026-09-02 5/250 2026-09-03 15:10 by T0rGB46095mJ
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 8/400 2026-09-03 14:48 by T0rGB46095mJ
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 9/450 2026-09-03 14:48 by T0rGB46095mJ
[基金申请] 国社科又开始会评了，不知道这次命运如何 +10 雨打竹帘 2026-08-30 14/700 2026-09-03 13:17 by qsd10086
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 8/400 2026-09-03 12:03 by T0rGB46095mJ
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +8 gdd2018 2026-08-28 13/650 2026-09-03 06:22 by 羽毛枫f
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 4/200 2026-09-03 03:14 by rM1TE0WVDIIY
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了，新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西，结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[基金申请] 面上函评意见出来了，像什么等级？ 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭