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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

[交流] 有关MS搜索过渡态的问题

看到不少有关搜索过渡态的文章,用的方法是高斯和MS中Dmol3的方法,想来这两种方法应该还是大家比较认可的,但是现在有不少人开始用MS中CASTEP版块来搜索过渡态,我也不是太懂,就想让大伙儿讨论下:MS中的Dmol3版块和CASTEP版块,搜索过渡态的优缺点,还有我们是否可以结合这两种方法?
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
看你做什么样的过渡态了。

分子体系肯定Gaussian更合适,DMol3差不多只能使用GGA水平,精度自然很渣,就算使用杂化泛函,速度也相当缓慢,意思不大。

如果是表面体系,gaussian肯定是不能做的,DMol3计算几乎不依赖晶格大小,这样能够取一个充分的真空层,并且Dmol3可以优化过渡态,则不行,而且真空层取大了根本算不动。但castep的好处是,表面如果含有金属原子,并且必须使用DFT+U方式才能够得到定性正确的情况下,dmol3就没辙了。不涉及这个问题,推荐还是使用DMol3。

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不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
5楼2015-10-24 10:38:46
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

引用回帖:
9楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-10-26 16:09:09
也不一定,要看哪些金属原子,而且DFT+U也并非所有体系都有改善,杂化泛函能好一些,但计算量颇大。...

假如体系中含有Fe原子是需要+U的方法吧,还有就是关于这个杂化泛函,是在设置中选择不同的泛函还是在计算性质中加入泛函?
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10楼2015-10-26 18:16:09
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zhenwuhuang

至尊木虫 (文学泰斗)

blessing in the last quarter of year 2015 ! ~~~~~~~~~~~~~
2楼2015-10-23 16:45:37
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DJBLOVEMY

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你可以看看教程,上面都有

发自小木虫Android客户端
3楼2015-10-23 16:52:09
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tyut sunwei

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
Dmol3的精度比较高,tcastep能做赝势,但那个不可以

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2015-10-23 20:07:35
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

引用回帖:
3楼: Originally posted by DJBLOVEMY at 2015-10-23 16:52:09
你可以看看教程,上面都有

具体是什么的教程,有这方面的比较吗?
知與誰同,與狼共舞。
6楼2015-10-26 15:35:54
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

引用回帖:
4楼: Originally posted by tyut sunwei at 2015-10-23 20:07:35
Dmol3的精度比较高,tcastep能做赝势,但那个不可以

想问的是它们的优缺点,castep是否也可以来研究过渡态,它的亮点是什么?
知與誰同,與狼共舞。
7楼2015-10-26 15:36:39
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

引用回帖:
5楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-10-24 10:38:46
看你做什么样的过渡态了。

分子体系肯定Gaussian更合适,DMol3差不多只能使用GGA水平,精度自然很渣,就算使用杂化泛函,速度也相当缓慢,意思不大。

如果是表面体系,gaussian肯定是不能做的,DMol3计算几乎 ...

谢谢!也就是说如果体系涉及到金属原子,就必须使用DFT+U的方法,才能准确的研究其过渡态?如果没用的话,是不准确的?
知與誰同,與狼共舞。
8楼2015-10-26 15:38:13
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by pcczhouwei at 2015-10-26 15:38:13
谢谢!也就是说如果体系涉及到金属原子,就必须使用DFT+U的方法,才能准确的研究其过渡态?如果没用的话,是不准确的?...

也不一定,要看哪些金属原子,而且DFT+U也并非所有体系都有改善,杂化泛函能好一些,但计算量颇大。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
9楼2015-10-26 16:09:09
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