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狗狗狗尾巴草

金虫 (小有名气)

[求助] 想问下各位虫友,这样的RNA能用么 已有1人参与

小女子刚开始提取RAN,材料来源于鱼体肝脏、脾脏和肠黏膜。我是取样后直接将组织放在TRIZOL中的。
所用匀浆器是180℃烘烤8个小时,枪头是买的现成RNase free,所用水(75%酒精和电解液)都是1-2%DEPC水搅拌4小时,再高温高压灭菌的。操作过程戴口罩,一次性手套也经常换。样品是2015年6月份取得,一直在-80℃冰箱。
提取方法如下:
1. 组织匀浆处理
2. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml氯仿,剧烈振荡15秒,室温放置3分钟。
3. 2-8℃10000×g离心15分钟。
4. 转移上清液到新的管子中,我取了500ul
5.加入500ul异丙醇,室温放置10分钟。
8. 2-8℃10000×g离心10分钟,移去上清。
9. 用75℅乙醇洗涤RNA沉淀。每使用1ml TRIzol至少加1ml 75℅乙醇。2-8℃不超过7500×g离心5分钟,弃上清。
10.剩余样品短暂离心后用枪头吸出多余的液体50-100μl无RNase的水,用枪头吸打几次,55-60℃放置10分钟。
所提取的RNA跑琼脂糖凝胶电泳,2%的,结果感觉不是很好。10月15好提取的样品上面两条带还是比较亮,后来的感觉降解了很多。
就想问下,像这样质量的RNA做反转录可以用么?我只打算反转录再做荧光定量的。
操作过程也希望各个大神们可以指点一二,谢谢。
有八个样品的是15号提取的,六个样品的是20号提取的。谢谢各位了

想问下各位虫友,这样的RNA能用么
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想问下各位虫友,这样的RNA能用么-1
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狗狗狗尾巴草

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by tolobio at 2015-10-23 06:45:14
有点降解,但是基本没问题。另外,如果用甲醛变性胶跑的话,应该会更漂亮些。

如果是这样的话,我就放心了,因为样品只有一份,搞砸了估计毕不了业了
7楼2015-10-23 08:42:51
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普通回帖

狗狗狗尾巴草

金虫 (小有名气)

我自己先顶下
2楼2015-10-22 21:10:14
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shucanwei

木虫 (正式写手)

唯以一人治天下,不以天下奉一人。
3楼2015-10-22 23:16:53
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shucanwei

木虫 (正式写手)

唯以一人治天下,不以天下奉一人。
4楼2015-10-22 23:19:13
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tolobio

新虫 (小有名气)


有点降解,但是基本没问题。另外,如果用甲醛变性胶跑的话,应该会更漂亮些。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2015-10-23 06:45:14
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狗狗狗尾巴草

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by shucanwei at 2015-10-22 23:16:53
效果不太好呀

是不太好,就是不知道还要注意些什么
6楼2015-10-23 08:41:24
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狗狗狗尾巴草

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by shucanwei at 2015-10-22 23:19:13
笫一条带降解比较严重

额,后来做的还是有很多像第一条带一样的。。。
8楼2015-10-23 08:43:34
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匿名

用户注销 (著名写手)


本帖仅楼主可见
9楼2015-10-23 10:42:32
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tuzkileon

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
确定能用,下一步直接反转录吧,不是用于测序的话影响不太大

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

10楼2015-10-25 15:39:49
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