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huangdelian银虫 (正式写手)
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想用高通量测序方法进行仔稚鱼摄食的调查
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本人在野外采集到了几个物种的仔稚鱼（很小，刚从鱼卵孵化没多久的幼鱼），想要对它摄食的食物进行调查。 看文献还不多，发现最近几年的摄食研究论文中采用有PNA（肽核酸）、qPCR、设计引物PCR+挑选阳性克隆测序方法、高通量测序方法。现在比较好的方法是高通量测序方法，但是这方面的文章还比较少，而且是做其他物种、成鱼的。 仔稚鱼本身个体非常小，提取它肠道内含物就更难，难以避免会有鱼本身的基因混在肠道内含物里面；而且鱼本身是哪个物种需要用分子鉴定手段才好确定，因此只是提取肠道内含物DNA操作不容易实现。因此，提取鱼体组织及肠道内含物基因在内的宏基因，然后再设计引物可能是其中一个可行的方法，但是应该怎么去设计引物呢？另外，想问下，如果用高通量测序的方法，是不是引物和前面刚提到的一样呢？用宏基因组的PCR产物怎样可以进行高通量测序呢？还请各位专家指点。 |
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