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关于蛋白同源建模的一些问题
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1.同源建模搜寻模板时候，有序列一致性很高的结晶蛋白，但是有的是含有配体有的是不含配体分子（我的这个蛋白是需要NADPH参与反应，有的晶体结构也是有apo和含有NADPH两种情况，但是都没有底物分子），那么我在同源建模的时候应该选用哪种作为模板是apo还是蛋白-NADPH 作为模板 2.分子建模的时候我是使用SWISSMODEL还是使用本地的MODELLER建模更好 3.建模的时候我是使用单一高序列一致性的单一模板还是考虑同时使用多个同源模板建模 小弟目前遇到以上一些问题，还望诸位高人不吝赐教 |
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