| 查看: 2406 | 回复: 12 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
怎样查找一个属的特有序列呢？求教高手！ 已有2人参与
|
|||
|
在做假单胞菌属的分析，需要查找到假单胞菌属的特有基因序列，但是无从下手。 已在Goog学术，几web of science查过相关文章，大部分只是叙述了相关蛋白或功能基因，一来没有公开序列，二来也没有说明是否是该属特有的。 头疼中…… 等待高手。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 【资源-分享】 |
» 猜你喜欢
含氟糖皮质激素的外用抗炎利器醋酸氟轻松
已经有0人回复
-
阿莫奈韦（Amenamevir）：解旋酶-引物酶靶向分子的结构特征与合成路径全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有298人回复
-
利瑞鲁单抗：靶向KIR的NK细胞检查点工具抗体，结构基础与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
fengjunchen
铜虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 745.1
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 77.2小时
- 虫号: 3548432
- 注册: 2014-11-20
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-10-03 21:51:42
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-10-03 21:51:42
|
不知你是要特有序列做啥……如果是FISH那类的原位分析，最好能找到相应的文献直接用人家的探针序列，比新手自己设计靠谱；如果是想设计引物pcr鉴定样品里有没有假单胞菌，先要确定用哪个基因检测，最好是假单胞菌特有的功能基因。 自己设计引物的话蛮麻烦的，最好能搜文献找到别人已设计好的，不然新手自己设计不一定好用。 如果非得自己设计，那么就在ncbi的序列搜索中搜索那个基因的序列，右侧filter下面根据物种的tree来选择所有假单胞菌的序列来分析其保守序列，我是用DNAman看序列比对；再下载此功能基因在其他科属中存在的序列，其他一个属下载一两条即可，然后分析上面找的那些保守序列哪些是假单胞菌特有的，就可以按照这些特有的保守序列设计引物。 发自小木虫Android客户端 |
6楼2015-10-01 10:39:12
2楼2015-09-29 19:18:20
3楼2015-09-30 23:38:13
4楼2015-10-01 10:23:42
