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[交流]
【求助】溶剂化’有质子转移的过渡态寻找出错
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溶剂化效应计算时 多次出现类似的情况，请前辈们帮忙看看是什么毛病。谢谢！ 输入命令（溶剂化效应下找过渡态）： %chk=402ts.chk %rwf=x1,200MW,x2,200MW,x3,200MW,x4,200MW,x5,200MW,x6,200MW,x7,-1 %mem=500mb %nproc=1 # Opt(QST3,Noeigen,maxcycle=1000) B3LYP/6-31+g(d,p) pop=nbo freq scrf=(IEFPCM,read,solvent=water) ……（下面是产物、反映物、过渡态的分子信息）（用过这组命令曾经计算出过过渡态） 输出文件最后部分： United Atom Topological Model (UA0 parameters set). UA0: Hydrogen 13 is unbound. Keep it explicit at all point on the UA0: potential energy surface to get meaningful results. Error termination via Lnk1e in e:\g03\l301.exe at Wed Jan 01 12:43:01 2003. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 10.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 1338 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 ps:真空状态下能算下去。 我比较了一下用同一行命令，那个曾经算出来的和这些算不出来的区别是：算不出来的共同点是在溶剂化效应下找过渡态都有质子氢的转移，出来结果的没有质子氢转移。而且out文件中也说“UA0: Hydrogen 13 is unbound. Keep it explicit at all point on the UA0: potential energy surface to get meaningful results.”其中H13就是转移的质子。 请问能不能给指导一下，该怎样修改才能往下算。心切啊。谢谢啦！！！ |
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结果可靠不可靠，要依据实验数据，理论计算本就用很多基组与方法的选择问题，这方面要多看文献才能了解，一般来说可以这样进行能量的比较： △Gsol(溶液条件下的相关能）＝△E（真空条件下总能量）＋△E0（零点能）＋△G‘sol（溶剂化能） 我以前做过一些溶剂条件下的优化，高斯的PCM模型并不是一个好的选择，（QM/MM应该是不错的方法）只是能提供一个估计的溶剂化能，对于过渡态而言，你这样想和这样做无可厚非，但并不是说这样就可得出一个可靠的结果，还是要以实验与文献为依据才行，理论计算如果不能说明实验，是没有意义的，如果你一定要在溶剂条件下优化的话，频率计算一定要分开，这在真空条件下可行，但在溶剂条件下是要出错的。 |
10楼2008-09-13 17:32:16
似乎解决了一小点问题，贴出来请大家在此基础上给指导一下2楼2008-09-05 08:58:02
3楼2008-09-05 09:44:07
4楼2008-09-05 23:50:26
5楼2008-09-08 21:37:57
6楼2008-09-11 19:04:21
7楼2008-09-11 19:10:22
8楼2008-09-11 19:20:12
谢谢啦9楼2008-09-12 09:36:47
