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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 实验技术 » 同一个昆虫个体中得到不同的CDNA序列，为什么？
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97546105

新虫 (小有名气)

[求助] 同一个昆虫个体中得到不同的CDNA序列，为什么？ 已有1人参与

在同一个昆虫个体中扩PCR,测序，得到不同的阳性克隆，本来以为是可变剪接，但是也不在内含子和外显子的交界处，为什么会出现这种状况？怎样才能确定基因的序列？
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1楼 2015-09-25 15:20:19
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 97546105 at 2015-09-25 16:43:49
我扩的是cDNA序列，测得个体还是比较多的，应该不是污染。
另外，用cDNA序列在基因组里面比对，只有一个地方能比对上，是不是说明只有这一个成员？...

你这不同的阳性克隆序列间差异大吗？
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4楼2015-09-25 18:20:52
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
同一家族其他成员？基因组DNA污染？
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2楼2015-09-25 16:18:04
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97546105

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-25 16:18:04
同一家族其他成员？基因组DNA污染？

我扩的是cDNA序列，测得个体还是比较多的，应该不是污染。
另外，用cDNA序列在基因组里面比对，只有一个地方能比对上，是不是说明只有这一个成员？
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3楼2015-09-25 16:43:49
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97546105

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-25 18:20:52
你这不同的阳性克隆序列间差异大吗？...

非常感谢你的关注
大的有十几个碱基差异或缺失，也有SNP位点
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5楼2015-09-25 19:39:29
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