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汕头大学海洋科学接受调剂
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97546105

新虫 (小有名气)

[求助] 同一个昆虫个体中得到不同的CDNA序列,为什么? 已有1人参与

在同一个昆虫个体中扩PCR,测序,得到不同的阳性克隆,本来以为是可变剪接,但是也不在内含子和外显子的交界处,为什么会出现这种状况?怎样才能确定基因的序列?
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
同一家族其他成员?基因组DNA污染?
2楼2015-09-25 16:18:04
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97546105

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-25 16:18:04
同一家族其他成员?基因组DNA污染?

我扩的是cDNA序列,测得个体还是比较多的,应该不是污染。
另外,用cDNA序列在基因组里面比对,只有一个地方能比对上,是不是说明只有这一个成员?
3楼2015-09-25 16:43:49
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 97546105 at 2015-09-25 16:43:49
我扩的是cDNA序列,测得个体还是比较多的,应该不是污染。
另外,用cDNA序列在基因组里面比对,只有一个地方能比对上,是不是说明只有这一个成员?...

你这不同的阳性克隆序列间差异大吗?
4楼2015-09-25 18:20:52
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97546105

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-25 18:20:52
你这不同的阳性克隆序列间差异大吗?...

非常感谢你的关注
大的有十几个碱基差异或缺失,也有SNP位点
5楼2015-09-25 19:39:29
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