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moroseman

新虫 (初入文坛)

[求助] 提RNA中的DNA污染问题以及RT-PCR 已有1人参与

本人刚接触分子生物,导师让我做一个,目的基因的表达量的确定。
我第一次提了RNA,然后做了RT-PCR,出现了很多问题,希望各位同学能给予我一些帮助。
1.        我是用simgen的植物总RNA提取试剂盒,提了RNA,结果如图1.RNA有降解,而且浓度严重不足,而我加的样品量也是足够的。手套,抢头,移液枪都是进口。我师姐提的RNA都是比较亮的,而我的严重不足。想询问下各位大神,如何提高RNA浓度?RNA浓度是100ng per ul   77ng per ul
2.        接下来又做了,RT-PCR,如图2,1.RNA 2.空 3.cDNA  4.DNA消化的RNA,5.RNA 用了mix做PCR,6.cDNA 用了MIX做PCR,7.DNA消化过的RNA。后三个都是用来MIX:是一种用于PCR只需加模板引物就行的混合液。跑胶跑了,3ul。问题来了,RNA中混了genemicDNA。
3.        为了检测 RNA中混有的genemicDNA量的大小。于是我又做了一次PCR 35cycle。如图3 control 1.RNA模板PCR(无反转录) 2.RNA 模板 mix(无反转录) 3.cDNA模板 4. cDNA mix
RNA加了50ng   cDNA 1ul由于RNA 80ng 20ul体系做RT,姑且算作cDNA为40ng per ul,结果也是不理想,还能继续往下做吗?
Note:实验室的DNA消化试剂盒出现了问题。
如何减少RNA中DNA的污染,以及提高RNA的浓度

提RNA中的DNA污染问题以及RT-PCR
1.jpg


提RNA中的DNA污染问题以及RT-PCR-1
2.jpg


提RNA中的DNA污染问题以及RT-PCR-2
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uulovelyuu

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你可以选用有去除基因组DNA步骤的RNA提取试剂盒或者RT试剂盒啊。我同学有用Tiangen产品的,其他公司应该也有类似产品。
2楼2015-10-21 10:17:25
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