应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请帮忙将结构式转为mol2 谢谢了
51/1返回列表
查看: 1772  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

张圆琳

铁虫 (小有名气)

[求助] 请帮忙将结构式转为mol2 谢谢了 已有1人参与

怎么加电荷

请帮忙将结构式转为mol2  谢谢了
untitled.png
回复此楼

» 猜你喜欢
要有新的想法，做了，就做好。
1楼 2015-09-22 23:53:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张圆琳

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-23 14:04:19
额，你用的哪个对接软件呢？我做对接属于幼儿园水平...

TarFisDock能预测分子的靶蛋白。上海药物所的，您要是能的话帮我搞一下。
赞一下 回复此楼
要有新的想法，做了，就做好。
5楼2015-09-23 18:10:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

张圆琳

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-23 09:22:42

Your Mol2 file is invalid, there is error in "Substructure" section:
  1 PHENYL 2 PERM 0 **** **** 1 ROOT   提示的是个这，什么问题啊？  您能帮我对接一下吗？
赞一下 回复此楼
要有新的想法，做了，就做好。
3楼2015-09-23 12:57:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

a86052

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 张圆琳 at 2015-09-23 12:57:53
Your Mol2 file is invalid, there is error in "Substructure" section:
  1 PHENYL 2 PERM 0 **** **** 1 ROOT   提示的是个这，什么问题啊？  您能帮我对接一下吗？...

额，你用的哪个对接软件呢？我做对接属于幼儿园水平
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-23 14:04:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

a86052

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 张圆琳 at 2015-09-23 18:10:54
TarFisDock能预测分子的靶蛋白。上海药物所的，您要是能的话帮我搞一下。...

这个软件没有用过额。。。话说这个mol2的文件的错误信息我不知道怎么改正，之前画好的分子用AutoDOCK没出现过这个问题。。。
赞一下 回复此楼
6楼2015-09-24 09:30:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 zICmwzsBXjbN 2026-08-29 5/250 2026-08-30 20:08 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zICmwzsBXjbN 2026-08-29 5/250 2026-08-30 20:08 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:46 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:37 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:34 by hZiFeudZyoGR
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:23 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-30 19:07 by xiangy672
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:01 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 18:51 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:07 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 9/450 2026-08-30 17:56 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 面上意见出来了 +9 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 18/900 2026-08-30 16:47 by 黄鸟于飞Chao
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +8 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:40 by l0VvVHGBGRLv
[考博] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-30 11:10 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭