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张圆琳

铁虫 (小有名气)

[求助] 请帮忙将结构式转为mol2 谢谢了 已有1人参与

怎么加电荷

请帮忙将结构式转为mol2  谢谢了
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要有新的想法,做了,就做好。
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a86052

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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  • 附件 1 : 2.mol2
  • 2015-09-23 09:22:27, 3.5 K
  • 附件 2 : 1.mol2
  • 2015-09-23 09:22:28, 3.51 K
2楼2015-09-23 09:22:42
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张圆琳

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-23 09:22:42

Your Mol2 file is invalid, there is error in "Substructure" section:
  1 PHENYL 2 PERM 0 **** **** 1 ROOT   提示的是个这,什么问题啊?  您能帮我对接一下吗?
要有新的想法,做了,就做好。
3楼2015-09-23 12:57:53
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a86052

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 张圆琳 at 2015-09-23 12:57:53
Your Mol2 file is invalid, there is error in "Substructure" section:
  1 PHENYL 2 PERM 0 **** **** 1 ROOT   提示的是个这,什么问题啊?  您能帮我对接一下吗?...

额,你用的哪个对接软件呢?我做对接属于幼儿园水平
4楼2015-09-23 14:04:19
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张圆琳

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-23 14:04:19
额,你用的哪个对接软件呢?我做对接属于幼儿园水平...

TarFisDock能预测分子的靶蛋白。上海药物所的,您要是能的话帮我搞一下。
要有新的想法,做了,就做好。
5楼2015-09-23 18:10:54
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a86052

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 张圆琳 at 2015-09-23 18:10:54
TarFisDock能预测分子的靶蛋白。上海药物所的,您要是能的话帮我搞一下。...

这个软件没有用过额。。。话说这个mol2的文件的错误信息我不知道怎么改正,之前画好的分子用AutoDOCK没出现过这个问题。。。
6楼2015-09-24 09:30:11
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张圆琳

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-24 09:30:11
这个软件没有用过额。。。话说这个mol2的文件的错误信息我不知道怎么改正,之前画好的分子用AutoDOCK没出现过这个问题。。。...

您可以帮我用您的autodock搞一下,可以的话我给你报酬。 我们实在没这条件啊,能帮忙的话最好。谢谢您
要有新的想法,做了,就做好。
7楼2015-09-24 18:30:40
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a86052

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 张圆琳 at 2015-09-24 18:30:40
您可以帮我用您的autodock搞一下,可以的话我给你报酬。 我们实在没这条件啊,能帮忙的话最好。谢谢您...

汗!我这幼儿园水平您都不怕么。。。你们单位应该各种做dock用的软件很多啊,这个autodock是个学术软件,安装个很容易,windows和Linux都行
8楼2015-09-25 08:55:15
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张圆琳

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-25 08:55:15
汗!我这幼儿园水平您都不怕么。。。你们单位应该各种做dock用的软件很多啊,这个autodock是个学术软件,安装个很容易,windows和Linux都行...

恩,那我先试试,这两天忙的要屎,没顾上看消息,非常感谢您。
要有新的想法,做了,就做好。
9楼2015-09-28 21:06:25
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