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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请帮忙将结构式转为mol2 谢谢了
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张圆琳

铁虫 (小有名气)

[求助] 请帮忙将结构式转为mol2 谢谢了 已有1人参与

怎么加电荷

请帮忙将结构式转为mol2  谢谢了
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要有新的想法，做了，就做好。
1楼 2015-09-22 23:53:03
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a86052

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
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2楼2015-09-23 09:22:42
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张圆琳

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-23 09:22:42

Your Mol2 file is invalid, there is error in "Substructure" section:
  1 PHENYL 2 PERM 0 **** **** 1 ROOT   提示的是个这，什么问题啊？  您能帮我对接一下吗？
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要有新的想法，做了，就做好。
3楼2015-09-23 12:57:53
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a86052

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 张圆琳 at 2015-09-23 12:57:53
Your Mol2 file is invalid, there is error in "Substructure" section:
  1 PHENYL 2 PERM 0 **** **** 1 ROOT   提示的是个这，什么问题啊？  您能帮我对接一下吗？...

额，你用的哪个对接软件呢？我做对接属于幼儿园水平
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4楼2015-09-23 14:04:19
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张圆琳

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-23 14:04:19
额，你用的哪个对接软件呢？我做对接属于幼儿园水平...

TarFisDock能预测分子的靶蛋白。上海药物所的，您要是能的话帮我搞一下。
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要有新的想法，做了，就做好。
5楼2015-09-23 18:10:54
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a86052

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 张圆琳 at 2015-09-23 18:10:54
TarFisDock能预测分子的靶蛋白。上海药物所的，您要是能的话帮我搞一下。...

这个软件没有用过额。。。话说这个mol2的文件的错误信息我不知道怎么改正，之前画好的分子用AutoDOCK没出现过这个问题。。。
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6楼2015-09-24 09:30:11
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张圆琳

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-24 09:30:11
这个软件没有用过额。。。话说这个mol2的文件的错误信息我不知道怎么改正，之前画好的分子用AutoDOCK没出现过这个问题。。。...

您可以帮我用您的autodock搞一下，可以的话我给你报酬。 我们实在没这条件啊，能帮忙的话最好。谢谢您
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要有新的想法，做了，就做好。
7楼2015-09-24 18:30:40
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a86052

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 张圆琳 at 2015-09-24 18:30:40
您可以帮我用您的autodock搞一下，可以的话我给你报酬。 我们实在没这条件啊，能帮忙的话最好。谢谢您...

汗！我这幼儿园水平您都不怕么。。。你们单位应该各种做dock用的软件很多啊，这个autodock是个学术软件，安装个很容易，windows和Linux都行
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8楼2015-09-25 08:55:15
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张圆琳

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-25 08:55:15
汗！我这幼儿园水平您都不怕么。。。你们单位应该各种做dock用的软件很多啊，这个autodock是个学术软件，安装个很容易，windows和Linux都行...

恩，那我先试试，这两天忙的要屎，没顾上看消息，非常感谢您。
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要有新的想法，做了，就做好。
9楼2015-09-28 21:06:25
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