应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助核苷酸序列比对和氨基酸序列比对问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 4708  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

cnzpli

金虫 (正式写手)

[求助] 求助核苷酸序列比对和氨基酸序列比对问题 已有2人参与

在进行核苷酸比对时某几个序列中间有个别碱基缺失，但是总体同源性很高。
然后换氨基酸序列比对后面的氨基酸出现连续的比不上，感觉氨基酸比对结果和碱基比对结果不是很一致，怀疑跟碱基缺失有关。
请问大家发文章怎么解释这个现象？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-09-21 23:34:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cnzpli

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-22 20:08:40
如果确定你的序列能翻译成蛋白质，那写文章时应以蛋白质序列比对结果为主。核酸序列中缺失一个碱基，对于核酸序列变化不大，但是引起移码突变后蛋白质序列差异可能会非常大。

就是这种现象，多重序列比对自动填充缺失碱基后比对氨基酸序列会好很多，而且符合预期，所以我应该把核苷酸比对去掉？
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-25 10:14:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

苏飞扬

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-09-22 22:17:46
是单个或连续两个碱基缺失吗？如果是，碱基缺失造成翻译的移码，读码框排序被改变，氨基酸序列差异自然变大。

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-22 00:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-09-22 22:18:07
如果确定你的序列能翻译成蛋白质，那写文章时应以蛋白质序列比对结果为主。核酸序列中缺失一个碱基，对于核酸序列变化不大，但是引起移码突变后蛋白质序列差异可能会非常大。
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-22 20:08:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cnzpli

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 苏飞扬 at 2015-09-22 00:07:59
是单个或连续两个碱基缺失吗？如果是，碱基缺失造成翻译的移码，读码框排序被改变，氨基酸序列差异自然变大。

道理我都懂，但是怎么解释呢？还是直接把核苷酸的比对丢掉？
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-25 10:12:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 274求调剂 +4 薛定谔的虎。 2026-04-01 4/200 2026-04-01 22:56 by wxiongid
[考研] 食品学硕362求调剂 +3 xuanxianxian 2026-04-01 3/150 2026-04-01 21:05 by 啊李999
[考研] 一志愿厦门大学化学工程（专硕）-数二英二406分-求调剂 +4 厦大化工 2026-04-01 4/200 2026-04-01 17:54 by JYD2011
[考研] 285求调剂 +7 AZMK 2026-03-30 13/650 2026-04-01 17:00 by 七度不信任
[考研] 0703化学/290求调剂/本科经历丰富/工科也可 +14 丹青奶盖 2026-03-26 16/800 2026-04-01 15:58 by oooqiao
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕 +7 @taotao 2026-03-30 7/350 2026-04-01 14:30 by chenqifeng666
[考研] 材料0856 英一数二 323 求调剂 +9 袁sy 2026-04-01 9/450 2026-04-01 14:30 by wangjy2002
[考研] 材料与化工调剂一志愿大连海事085600，349 +9 吃的不少 2026-03-30 9/450 2026-04-01 11:24 by wangjy2002
[考研] 环境工程 085701，267求调剂 +15 minht 2026-03-29 16/800 2026-04-01 10:13 by li_sujuan99
[考研] 求调剂：085600材料与化工，考材科基，总分319 +17 678lucky 2026-03-31 21/1050 2026-04-01 01:40 by 1018329917
[考研] 375求调剂 +7 雨夏整夜 2026-03-29 7/350 2026-03-31 18:52 by xhai2011
[考研] 070300化学354求调剂 +15 101次希望 2026-03-28 15/750 2026-03-31 17:58 by jp9609
[考研] 340求调剂 +4 希望如此i 2026-03-31 4/200 2026-03-31 16:40 by 690616278
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学材料与化工方向336分 +13 辰沐5211314 2026-03-26 13/650 2026-03-31 14:37 by 记事本2026
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +16 李李不服输 2026-03-26 16/800 2026-03-30 17:47 by wangjy2002
[考研] 394求调剂 +3 好事多磨静候佳� 2026-03-26 5/250 2026-03-28 14:24 by 唐沐儿
[考研] 331环境科学与工程求调剂 +3 熠然好运气 2026-03-27 3/150 2026-03-28 04:11 by fmesaito
[考研] 275求调剂 +10 jjjjjjjjjjl 2026-03-27 10/500 2026-03-27 23:47 by barnett0632
[考研] 265求调剂 +8 小木虫085600 2026-03-27 8/400 2026-03-27 22:16 by 无际的草原
[考研] 调剂 +3 李嘉图·S·路 2026-03-27 3/150 2026-03-27 11:19 by wangjy2002
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭