应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助核苷酸序列比对和氨基酸序列比对问题
61/1返回列表
查看: 5000  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

cnzpli

金虫 (正式写手)

[求助] 求助核苷酸序列比对和氨基酸序列比对问题 已有2人参与

在进行核苷酸比对时某几个序列中间有个别碱基缺失，但是总体同源性很高。
然后换氨基酸序列比对后面的氨基酸出现连续的比不上，感觉氨基酸比对结果和碱基比对结果不是很一致，怀疑跟碱基缺失有关。
请问大家发文章怎么解释这个现象？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-09-21 23:34:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

苏飞扬

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-09-22 22:17:46
是单个或连续两个碱基缺失吗？如果是，碱基缺失造成翻译的移码，读码框排序被改变，氨基酸序列差异自然变大。

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-22 00:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-09-22 22:18:07
如果确定你的序列能翻译成蛋白质，那写文章时应以蛋白质序列比对结果为主。核酸序列中缺失一个碱基，对于核酸序列变化不大，但是引起移码突变后蛋白质序列差异可能会非常大。
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-22 20:08:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cnzpli

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 苏飞扬 at 2015-09-22 00:07:59
是单个或连续两个碱基缺失吗？如果是，碱基缺失造成翻译的移码，读码框排序被改变，氨基酸序列差异自然变大。

道理我都懂，但是怎么解释呢？还是直接把核苷酸的比对丢掉？
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-25 10:12:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cnzpli

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-22 20:08:40
如果确定你的序列能翻译成蛋白质，那写文章时应以蛋白质序列比对结果为主。核酸序列中缺失一个碱基，对于核酸序列变化不大，但是引起移码突变后蛋白质序列差异可能会非常大。

就是这种现象，多重序列比对自动填充缺失碱基后比对氨基酸序列会好很多，而且符合预期，所以我应该把核苷酸比对去掉？
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-25 10:14:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by cnzpli at 2015-09-25 10:14:21
就是这种现象，多重序列比对自动填充缺失碱基后比对氨基酸序列会好很多，而且符合预期，所以我应该把核苷酸比对去掉？...

建议只用蛋白质比对结果，并说明出现较大差异的原因是核苷酸缺失引起移码突变，核酸序列比对结果并没有什么意义。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2015-09-25 14:55:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cnzpli 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +3 wangyl_123 2026-10-10 6/300 2026-10-11 15:04 by Abin0406
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 14:13 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:53 by VOMexwnDzOFZ
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 10:53 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +3 好运来～9527 2026-10-10 5/250 2026-10-11 09:00 by 好运来～9527
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬，路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭