应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助核苷酸序列比对和氨基酸序列比对问题
61/1返回列表
查看: 4991  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

cnzpli

金虫 (正式写手)

[求助] 求助核苷酸序列比对和氨基酸序列比对问题 已有2人参与

在进行核苷酸比对时某几个序列中间有个别碱基缺失，但是总体同源性很高。
然后换氨基酸序列比对后面的氨基酸出现连续的比不上，感觉氨基酸比对结果和碱基比对结果不是很一致，怀疑跟碱基缺失有关。
请问大家发文章怎么解释这个现象？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-09-21 23:34:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

苏飞扬

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-09-22 22:17:46
是单个或连续两个碱基缺失吗？如果是，碱基缺失造成翻译的移码，读码框排序被改变，氨基酸序列差异自然变大。

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-22 00:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-09-22 22:18:07
如果确定你的序列能翻译成蛋白质，那写文章时应以蛋白质序列比对结果为主。核酸序列中缺失一个碱基，对于核酸序列变化不大，但是引起移码突变后蛋白质序列差异可能会非常大。
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-22 20:08:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cnzpli

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 苏飞扬 at 2015-09-22 00:07:59
是单个或连续两个碱基缺失吗？如果是，碱基缺失造成翻译的移码，读码框排序被改变，氨基酸序列差异自然变大。

道理我都懂，但是怎么解释呢？还是直接把核苷酸的比对丢掉？
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-25 10:12:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cnzpli

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-22 20:08:40
如果确定你的序列能翻译成蛋白质，那写文章时应以蛋白质序列比对结果为主。核酸序列中缺失一个碱基，对于核酸序列变化不大，但是引起移码突变后蛋白质序列差异可能会非常大。

就是这种现象，多重序列比对自动填充缺失碱基后比对氨基酸序列会好很多，而且符合预期，所以我应该把核苷酸比对去掉？
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-25 10:14:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by cnzpli at 2015-09-25 10:14:21
就是这种现象，多重序列比对自动填充缺失碱基后比对氨基酸序列会好很多，而且符合预期，所以我应该把核苷酸比对去掉？...

建议只用蛋白质比对结果，并说明出现较大差异的原因是核苷酸缺失引起移码突变，核酸序列比对结果并没有什么意义。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2015-09-25 14:55:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cnzpli 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:44 by XgCC8uTcwILl
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:42 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:39 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:32 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:08 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:05 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:53 by XgCC8uTcwILl
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:50 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 6/300 2026-09-27 05:42 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 5/250 2026-09-25 11:19 by yhq9807
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 7/350 2026-09-25 11:18 by yhq9807
[硕博家园] 上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生 +4 oxidpl 2026-09-20 6/300 2026-09-24 20:40 by oxidpl
[教师之家] 课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向 +4 oxidpl 2026-09-20 6/300 2026-09-24 20:37 by oxidpl
[基金申请] 师弟论文见刊大半年才想起来申请专利，还能抢救一下吗？ +4 13108017953 2026-09-21 4/200 2026-09-24 10:06 by kudofaye
[有机交流] 有机合成以后会不会被AI改变？做科研的虫友怎么看 +5 zapen 2026-09-20 8/400 2026-09-23 17:21 by tianxiaoxian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭