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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 求助！在线等！急急急！怎么查找某基因SNP突变位点？？
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柳弯儿

新虫 (正式写手)

[求助] 求助！在线等！急急急！怎么查找某基因SNP突变位点？？已有3人参与

正常的只要有rs号就可以直接查找SNP序列及突变位置，但是我有一个查不到，急求帮助啊！
G蛋白β3亚单位 C825  这个，可以缩写为GNB3 C825，我查文献得知它是C/T突变，但是不会在序列中找到位置，求详细方法！！！
而且我不太明白C825这个概念，大神求助，万分感谢！
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1楼2015-09-17 09:32:18
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Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
柳弯儿: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-17 21:06:41
重新查了一下，现在的RS号是rs5443，NCBI上描述是c.825C>T，意思是CDS序列上第825个碱基是C或者T，是一个同义突变，氨基酸不改变的。
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3楼2015-09-17 12:04:55
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Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
Rs5810761，不知道对不对，我先吃饭去，吃完饭跟你说。
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2楼2015-09-17 11:28:37
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柳弯儿

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Esther_zhang at 2015-09-17 12:04:55
重新查了一下，现在的RS号是rs5443，NCBI上描述是c.825C>T，意思是CDS序列上第825个碱基是C或者T，是一个同义突变，氨基酸不改变的。

嗯嗯  那我的就对了  谢谢你   大神  再请教你一个问题，谅解我不是搞分生的，很多东西不明白。
我做的是SNP，我打算用酶切的方法，我如果想直接用文献中的引物，但是文献中是直接测序，没有给出内切酶及酶切位点，我该怎么办？？？急求指教！感谢不已！
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4楼2015-09-17 21:06:16
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ypslly

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
在ncbi或者ensembl上把那个基因的全序列找到，就可以看到snp和周围的序列了。

发自小木虫Android客户端
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5楼2015-09-17 22:45:19
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