应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 求助！在线等！急急急！怎么查找某基因SNP突变位点？？
131/2返回列表12下一页
查看: 3547  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

柳弯儿

新虫 (正式写手)

[求助] 求助！在线等！急急急！怎么查找某基因SNP突变位点？？ 已有3人参与

正常的只要有rs号就可以直接查找SNP序列及突变位置，但是我有一个查不到，急求帮助啊！
G蛋白β3亚单位 C825  这个，可以缩写为GNB3 C825，我查文献得知它是C/T突变，但是不会在序列中找到位置，求详细方法！！！
而且我不太明白C825这个概念，大神求助，万分感谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

核酸方面

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-09-17 09:32:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
Rs5810761，不知道对不对，我先吃饭去，吃完饭跟你说。
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-17 11:28:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
柳弯儿: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-17 21:06:41
重新查了一下，现在的RS号是rs5443，NCBI上描述是c.825C>T，意思是CDS序列上第825个碱基是C或者T，是一个同义突变，氨基酸不改变的。
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-17 12:04:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柳弯儿

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Esther_zhang at 2015-09-17 12:04:55
重新查了一下，现在的RS号是rs5443，NCBI上描述是c.825C>T，意思是CDS序列上第825个碱基是C或者T，是一个同义突变，氨基酸不改变的。

嗯嗯  那我的就对了  谢谢你   大神  再请教你一个问题，谅解我不是搞分生的，很多东西不明白。
我做的是SNP，我打算用酶切的方法，我如果想直接用文献中的引物，但是文献中是直接测序，没有给出内切酶及酶切位点，我该怎么办？？？急求指教！感谢不已！
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-17 21:06:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ypslly

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
在ncbi或者ensembl上把那个基因的全序列找到，就可以看到snp和周围的序列了。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-17 22:45:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ypslly

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-09-17 21:06:16
嗯嗯  那我的就对了  谢谢你   大神  再请教你一个问题，谅解我不是搞分生的，很多东西不明白。
我做的是SNP，我打算用酶切的方法，我如果想直接用文献中的引物，但是文献中是直接测序，没有给出内切酶及酶切位点 ...

snp那也不一定就有酶切位点。看了序列就知道了

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2015-09-17 22:46:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柳弯儿

新虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ypslly at 2015-09-17 22:46:20
snp那也不一定就有酶切位点。看了序列就知道了
...

唉，查来查去一头雾水啊，能不能说得详细点呢  大神
赞一下 回复此楼
7楼2015-09-18 08:12:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柳弯儿

新虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-09-18 08:12:34
唉，查来查去一头雾水啊，能不能说得详细点呢  大神...

序列已找到，就是酶切的部分不知道怎么下手，怎么查起，能不能教一下，我主要不是啊学生化的，查出来的东西也不知道对错
赞一下 回复此楼
8楼2015-09-18 08:14:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Esther_zhang

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-09-18 08:14:24
序列已找到，就是酶切的部分不知道怎么下手，怎么查起，能不能教一下，我主要不是啊学生化的，查出来的东西也不知道对错...

你可以用DNAstar的MAPDRAW分析序列，看SNP那有没有酶切位点，金标准就是测序，所以还是测吧，测一个序列没有几个钱。别喊大神，我现在是分子生物才入门，纯菜鸟一个
赞一下 回复此楼
9楼2015-09-18 08:45:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gayalynau

铁杆木虫 (著名写手)

嗨

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
给你个网站，把序列贴进去（2个序列，最好只有1个SNP，这样的话），就可以用在线软件预测有没有限制性内切酶
赞一下 回复此楼
嗨
10楼2015-09-18 08:55:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 柳弯儿 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭