24小时热门版块排行榜    

查看: 3859  |  回复: 12

柳弯儿

新虫 (正式写手)

[求助] 求助!在线等!急急急!怎么查找某基因SNP突变位点?? 已有3人参与

正常的只要有rs号就可以直接查找SNP序列及突变位置,但是我有一个查不到,急求帮助啊!
G蛋白β3亚单位 C825  这个,可以缩写为GNB3 C825,我查文献得知它是C/T突变,但是不会在序列中找到位置,求详细方法!!!
而且我不太明白C825这个概念,大神求助,万分感谢!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

核酸方面

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
Rs5810761,不知道对不对,我先吃饭去,吃完饭跟你说。
2楼2015-09-17 11:28:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
柳弯儿: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-17 21:06:41
重新查了一下,现在的RS号是rs5443,NCBI上描述是c.825C>T,意思是CDS序列上第825个碱基是C或者T,是一个同义突变,氨基酸不改变的。
3楼2015-09-17 12:04:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柳弯儿

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Esther_zhang at 2015-09-17 12:04:55
重新查了一下,现在的RS号是rs5443,NCBI上描述是c.825C>T,意思是CDS序列上第825个碱基是C或者T,是一个同义突变,氨基酸不改变的。

嗯嗯  那我的就对了  谢谢你   大神  再请教你一个问题,谅解我不是搞分生的,很多东西不明白。
我做的是SNP,我打算用酶切的方法,我如果想直接用文献中的引物,但是文献中是直接测序,没有给出内切酶及酶切位点,我该怎么办???急求指教!感谢不已!
4楼2015-09-17 21:06:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ypslly

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在ncbi或者ensembl上把那个基因的全序列找到,就可以看到snp和周围的序列了。

发自小木虫Android客户端
5楼2015-09-17 22:45:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ypslly

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-09-17 21:06:16
嗯嗯  那我的就对了  谢谢你   大神  再请教你一个问题,谅解我不是搞分生的,很多东西不明白。
我做的是SNP,我打算用酶切的方法,我如果想直接用文献中的引物,但是文献中是直接测序,没有给出内切酶及酶切位点 ...

snp那也不一定就有酶切位点。看了序列就知道了

发自小木虫Android客户端
6楼2015-09-17 22:46:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柳弯儿

新虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ypslly at 2015-09-17 22:46:20
snp那也不一定就有酶切位点。看了序列就知道了
...

唉,查来查去一头雾水啊,能不能说得详细点呢  大神
7楼2015-09-18 08:12:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柳弯儿

新虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-09-18 08:12:34
唉,查来查去一头雾水啊,能不能说得详细点呢  大神...

序列已找到,就是酶切的部分不知道怎么下手,怎么查起,能不能教一下,我主要不是啊学生化的,查出来的东西也不知道对错
8楼2015-09-18 08:14:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-09-18 08:14:24
序列已找到,就是酶切的部分不知道怎么下手,怎么查起,能不能教一下,我主要不是啊学生化的,查出来的东西也不知道对错...

你可以用DNAstar的MAPDRAW分析序列,看SNP那有没有酶切位点,金标准就是测序,所以还是测吧,测一个序列没有几个钱。别喊大神,我现在是分子生物才入门,纯菜鸟一个
9楼2015-09-18 08:45:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gayalynau

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
给你个网站,把序列贴进去(2个序列,最好只有1个SNP,这样的话),就可以用在线软件预测有没有限制性内切酶
10楼2015-09-18 08:55:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 柳弯儿 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +16 基诺咪客 2026-08-17 20/1000 2026-08-20 12:44 by 201120518022
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +16 Ldrop2023 2026-08-13 20/1000 2026-08-20 11:07 by xskun
[基金申请] 言之凿凿,8月21号(明天)放榜 +12 医学老男孩 2026-08-20 14/700 2026-08-20 10:53 by ran2233
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +55 医学老男孩 2026-08-13 125/6250 2026-08-20 09:02 by 医学老男孩
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见