应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 求助！在线等！急急急！怎么查找某基因SNP突变位点？？
131/2返回列表12下一页
查看: 3871  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

柳弯儿

新虫 (正式写手)

[求助] 求助！在线等！急急急！怎么查找某基因SNP突变位点？？ 已有3人参与

正常的只要有rs号就可以直接查找SNP序列及突变位置，但是我有一个查不到，急求帮助啊！
G蛋白β3亚单位 C825  这个，可以缩写为GNB3 C825，我查文献得知它是C/T突变，但是不会在序列中找到位置，求详细方法！！！
而且我不太明白C825这个概念，大神求助，万分感谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

核酸方面

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-09-17 09:32:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
Rs5810761，不知道对不对，我先吃饭去，吃完饭跟你说。
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-17 11:28:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
柳弯儿: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-17 21:06:41
重新查了一下，现在的RS号是rs5443，NCBI上描述是c.825C>T，意思是CDS序列上第825个碱基是C或者T，是一个同义突变，氨基酸不改变的。
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-17 12:04:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柳弯儿

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Esther_zhang at 2015-09-17 12:04:55
重新查了一下，现在的RS号是rs5443，NCBI上描述是c.825C>T，意思是CDS序列上第825个碱基是C或者T，是一个同义突变，氨基酸不改变的。

嗯嗯  那我的就对了  谢谢你   大神  再请教你一个问题，谅解我不是搞分生的，很多东西不明白。
我做的是SNP，我打算用酶切的方法，我如果想直接用文献中的引物，但是文献中是直接测序，没有给出内切酶及酶切位点，我该怎么办？？？急求指教！感谢不已！
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-17 21:06:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ypslly

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
在ncbi或者ensembl上把那个基因的全序列找到，就可以看到snp和周围的序列了。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-17 22:45:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ypslly

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-09-17 21:06:16
嗯嗯  那我的就对了  谢谢你   大神  再请教你一个问题，谅解我不是搞分生的，很多东西不明白。
我做的是SNP，我打算用酶切的方法，我如果想直接用文献中的引物，但是文献中是直接测序，没有给出内切酶及酶切位点 ...

snp那也不一定就有酶切位点。看了序列就知道了

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2015-09-17 22:46:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柳弯儿

新虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ypslly at 2015-09-17 22:46:20
snp那也不一定就有酶切位点。看了序列就知道了
...

唉，查来查去一头雾水啊，能不能说得详细点呢  大神
赞一下 回复此楼
7楼2015-09-18 08:12:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柳弯儿

新虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-09-18 08:12:34
唉，查来查去一头雾水啊，能不能说得详细点呢  大神...

序列已找到，就是酶切的部分不知道怎么下手，怎么查起，能不能教一下，我主要不是啊学生化的，查出来的东西也不知道对错
赞一下 回复此楼
8楼2015-09-18 08:14:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Esther_zhang

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-09-18 08:14:24
序列已找到，就是酶切的部分不知道怎么下手，怎么查起，能不能教一下，我主要不是啊学生化的，查出来的东西也不知道对错...

你可以用DNAstar的MAPDRAW分析序列，看SNP那有没有酶切位点，金标准就是测序，所以还是测吧，测一个序列没有几个钱。别喊大神，我现在是分子生物才入门，纯菜鸟一个
赞一下 回复此楼
9楼2015-09-18 08:45:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gayalynau

铁杆木虫 (著名写手)

嗨

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
给你个网站，把序列贴进去（2个序列，最好只有1个SNP，这样的话），就可以用在线软件预测有没有限制性内切酶
赞一下 回复此楼
嗨
10楼2015-09-18 08:55:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 柳弯儿 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 3/150 2026-08-22 22:03 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-22 21:42 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 7/350 2026-08-22 21:39 by OEbVnUOu01ol
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +3 简单化xn 2026-08-22 7/350 2026-08-22 19:46 by 简单化xn
[基金申请] 什么时候开奖？ +7 CrisMessi 2026-08-18 8/400 2026-08-22 18:29 by 淀粉搬运工
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 今天放榜吗？ +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭