24小时热门版块排行榜    

查看: 1522  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

weiyuanzheng

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于肠道细菌基因组的提取问题 已有4人参与

各位老师,师兄师姐好!小虫最近开始做肠道微生物的PCR-DGGE鉴定,有几个问题想请教一下:1.肠道微生物的取样很有可能会混有宿主肠组织,那么提取出的细菌基因组会污染宿主组织DNA吗?2.PCR时选用的细菌V3区设计通用引物,因为基因组不纯,会不会把宿主基因也扩出来?3.小虫用的是斑马鱼,鱼体太小,肠道内溶物很难取样,请教有什么好的方法吗?我参考文献,只能把肠取出后,剪碎,然后滤去大碎片。
回复此楼
没有人生来洒脱,都总是在哭过以后才会感到轻松许多。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

余丽华

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by weiyuanzheng at 2015-09-12 10:22:09
嘿嘿,查阅了一下文献,给自己补充一下知识回顾,宿主基因组是扩不出来细菌16s的,因为差别太大,所以污染的问题应该影响不大。。。

楼主最后是如何提取肠道微生物基因组呢!我最近准备做提取蜘蛛肠道微生物基因组。求指教
8楼2017-12-22 21:13:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

weiyuanzheng

铜虫 (小有名气)

嘿嘿,查阅了一下文献,给自己补充一下知识回顾,宿主基因组是扩不出来细菌16s的,因为差别太大,所以污染的问题应该影响不大。。。
没有人生来洒脱,都总是在哭过以后才会感到轻松许多。
2楼2015-09-12 10:22:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ypan

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-09-28 22:51:50
肠道微生物的DNA获取最关键的步骤是把肠道微生物破碎,让DNA释放出来,市场上有专门针对此类特殊样品的试剂盒,粪便DNA提取试剂盒。qiagen、invitrogen、MP等都有此类试剂盒的
3楼2015-09-28 15:04:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

品茗听雨0530

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-09-28 22:52:11
PCR是扩不出宿主的DNA的,因为原核生物的16S是核糖体,而真核生物的16S是线粒体,加上引物的特异性你就放心好了。
4楼2015-09-28 21:54:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 明天应该可查了!? +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +7 图啦图啦 2026-08-24 8/400 2026-08-24 22:00 by maomao_da
[基金申请] 人气不行了 +10 fansofjerry 2026-08-21 10/500 2026-08-24 21:03 by zhanghaozhu
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见