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quintas

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于短链脂肪酸的创新低精度测定方法

虫友们,求助帖!

关于短链脂肪酸,例如丁酸,罗列下我们普遍应用的测定方法,保护性提取样品后GC,也有HPLC MS的,甚至还有EMI MS/MS,这些统统不理会,我需要大家完全放开思维然后帮帮我,思路如下:

  背景:我们有一些特定的来自肠道的菌群,每群约15-35个种,为了鉴定不同的方法得到的菌群有什么益生的功能,我们需要对菌群进行相关的产物检测,有益还是有害可以通过对菌的Meta基因组功能注释来判别,已经确定有益的,会有一些可以检测的益生指标,比如脂肪酸,单糖,酵素,维生素。

  问题:对于短链脂肪酸的组成与含量我们如何才能大通量的对不同的菌群进行粗略测定,因为会有不同的优化与对照,经费不可能多到几千种样每个都测个GC,有什么简便,快速的方法能够让我们对不同菌群进行大批量检测,最理想的情况是底物显色,直接间接均可,然后利用酶标仪检测,但是瓶颈如下:
      短链脂肪酸易挥发,理想状况是直接在孔中裂解,然后特异性反应,检测之,
         -但短链脂肪酸的化学性质很普通,含有末端羧基神码的,如何应用显色反应?
         -直接裂解细菌会释放大量蛋白例如活性酶,糖,等等如何避免对目标的干扰?
      如果退一步,每个样品都提总脂,
         -由于样品挥发我们能不能加热只回收检测挥发相,从而保证结果的相对准确?
         -根据脂肪酸设计的相关反应会不会由于某些菌产的中长链脂肪酸而产生干扰?
      再退一步,上述各种都不考虑,毕竟只是大范围初筛,后期会有针对性的进行GC,LCMS等实验,我们怎样获得不精确的但是能够大体确定范围的脂肪酸测定方法?

综上,能综合测定的方法故然好,单一产物能够测定我也很知足。层析,色谱,光谱,化学反应,大家尽情发挥优秀答案追加100金~主要要求,简单,快捷,大通量。
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quintas

铜虫 (小有名气)

要不要这么冷清
2楼2014-05-02 22:02:42
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