24小时热门版块排行榜    

查看: 1884  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

白玉浴血

木虫 (正式写手)

[求助] 请问VMD读取的trr轨迹文件的时间间隔和什么有关系呢? 已有1人参与

请问VMD读取的trr轨迹文件的时间间隔和什么有关系呢?
MD的.mdp文件中dt=0.02,nstxout=1000,总共运行了20ns,这样的情况怎么计算啊?
我的理解是这样的:每1000步提取一帧,然后每步的时间是0.02ps,所以应该是20ps提取一次,所以20ns应该有1000帧,不知道哪里出错啦,帮忙给分析一下吧。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzm9525

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 白玉浴血 at 2015-09-10 09:00:02
不明白,这要怎么查看呢...

你要没分就不用查了啊,,我之前都是嫌太大,给手动分了分,才会有帧数减少的情况,,可别误导了。
倔强不是好事情,可是我们如何分得清何为倔强何为执著
7楼2015-09-10 09:01:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

wzm9525

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
每1000步输出一次,每步0.02fs,是不是就对了。
倔强不是好事情,可是我们如何分得清何为倔强何为执著
2楼2015-09-10 08:16:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

白玉浴血

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wzm9525 at 2015-09-10 08:16:42
每1000步输出一次,每步0.02fs,是不是就对了。

我的vmd在20ns输出了179帧
3楼2015-09-10 08:39:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzm9525

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 白玉浴血 at 2015-09-10 08:39:19
我的vmd在20ns输出了179帧...

....好吧,,等其他大神吧。。
倔强不是好事情,可是我们如何分得清何为倔强何为执著
4楼2015-09-10 08:53:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 72/3600 2026-08-16 13:15 by 医学老男孩
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
信息提示
请填处理意见