24小时热门版块排行榜    

查看: 1711  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

白玉浴血

木虫 (正式写手)

[求助] 请问VMD读取的trr轨迹文件的时间间隔和什么有关系呢? 已有1人参与

请问VMD读取的trr轨迹文件的时间间隔和什么有关系呢?
MD的.mdp文件中dt=0.02,nstxout=1000,总共运行了20ns,这样的情况怎么计算啊?
我的理解是这样的:每1000步提取一帧,然后每步的时间是0.02ps,所以应该是20ps提取一次,所以20ns应该有1000帧,不知道哪里出错啦,帮忙给分析一下吧。
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzm9525

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 白玉浴血 at 2015-09-10 08:39:19
我的vmd在20ns输出了179帧...

....好吧,,等其他大神吧。。
倔强不是好事情,可是我们如何分得清何为倔强何为执著
4楼2015-09-10 08:53:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

wzm9525

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
每1000步输出一次,每步0.02fs,是不是就对了。
倔强不是好事情,可是我们如何分得清何为倔强何为执著
2楼2015-09-10 08:16:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

白玉浴血

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wzm9525 at 2015-09-10 08:16:42
每1000步输出一次,每步0.02fs,是不是就对了。

我的vmd在20ns输出了179帧
3楼2015-09-10 08:39:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzm9525

银虫 (小有名气)

会不会是trj轨迹文件分割了?
倔强不是好事情,可是我们如何分得清何为倔强何为执著
5楼2015-09-10 08:55:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 石河子大学(211、双一流)硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 307求调剂 +11 冷笙123 2026-03-17 11/550 2026-03-22 20:16 by edmund7
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +11 梨花珞晚风 2026-03-17 11/550 2026-03-22 17:42 by luoyongfeng
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 299求调剂 +4 某某某某位 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:30 by barlinike
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 南昌大学材料专硕311分求调剂 +6 77chaselx 2026-03-20 6/300 2026-03-21 07:24 by JourneyLucky
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +8 小材化本科 2026-03-18 8/400 2026-03-20 23:16 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂求学校推荐 +3 伯乐29 2026-03-18 5/250 2026-03-20 22:59 by JourneyLucky
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 环境工程调剂 +9 大可digkids 2026-03-16 9/450 2026-03-20 17:38 by 醉在风里
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
信息提示
请填处理意见