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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 求VMD脚本 计算轨迹文件的溶剂可及表面sasa已有1人参与

我的体系包含polymer和solvent,我需要计算polymer的溶剂可及表面,搜到的一些命令,如:
set all [atomselect top "all"]
set some [atomselect top "resid 1 to 5"]
measure sasa 1.4 $all -restrict $some
是可以计算一帧的sasa,但是我要计算轨迹文件的sasa随模拟时间的变化,也就是把每一帧的sasa都输出,求脚本。
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 声梦奇缘001 at 2015-08-26 18:09:16
VMD 的measure 命令可以实现这个功能,具体的可以参考 VMD 手册

3楼2015-08-26 19:07:50
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