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gromac跑完动力学以后,用VMD计算每一帧构象的溶剂可及表面积,求TCL脚本
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| 用gromacs跑完动力学以后,将md轨迹文件md.trr中的3000帧构象提取了出来,共3000个gro文件,接下来用VMD计算每一个构象的溶剂可及面积。这个工作在vmd中TK Console控制台来完成,用的都是tcl的命令,且每次只能处理一个构象。有计算高手做过类似的问题吗?或者有TCL高手能来指点下吗?求Tcl脚本! |
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