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高桥FC

新虫 (初入文坛)

[交流] amber跑出结果的结合自由能为正值,怎么破?

amber进行蛋白质和小分子的动力学模拟运算,RMSD后期已趋平稳,温度 密度 势能的监控都很正常,
但是各项能量均为正值,都是正零点几的样子,总结合能正一点几,用PBSA和GBSA两种,结果都差不多。
这是什么原因导致的呢?是复合物结合系统本身的问题吗?求助
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应化43

金虫 (小有名气)


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😊

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-08-26 16:43:36
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高桥FC(金币+1): 谢谢参与
本帖仅楼主可见
3楼2015-08-26 16:49:08
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高桥FC(金币+1): 谢谢参与
4楼2015-08-26 16:57:31
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高桥FC(金币+1): 谢谢参与
5楼2015-08-26 16:57:34
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高桥FC(金币+1): 谢谢参与
祝福
6楼2015-08-26 16:58:05
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高桥FC(金币+1): 谢谢参与
7楼2015-08-26 17:00:29
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高桥FC(金币+1): 谢谢参与
8楼2015-08-26 17:01:58
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9楼2015-08-26 17:08:17
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10楼2015-08-26 17:22:15
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