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amber跑出结果的结合自由能为正值，怎么破？
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amber进行蛋白质和小分子的动力学模拟运算，RMSD后期已趋平稳，温度 密度 势能的监控都很正常， 但是各项能量均为正值，都是正零点几的样子，总结合能正一点几，用PBSA和GBSA两种，结果都差不多。 这是什么原因导致的呢？是复合物结合系统本身的问题吗？求助 |
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2楼2015-08-26 16:43:36
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 本帖仅楼主可见 |
3楼2015-08-26 16:49:08
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4楼2015-08-26 16:57:31
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6楼2015-08-26 16:58:05
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7楼2015-08-26 17:00:29
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8楼2015-08-26 17:01:58
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9楼2015-08-26 17:08:17
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