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amber跑出结果的结合自由能为正值，怎么破？
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amber进行蛋白质和小分子的动力学模拟运算，RMSD后期已趋平稳，温度 密度 势能的监控都很正常， 但是各项能量均为正值，都是正零点几的样子，总结合能正一点几，用PBSA和GBSA两种，结果都差不多。 这是什么原因导致的呢？是复合物结合系统本身的问题吗？求助 |
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