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daxu

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 请高手帮忙看我用diamond画的晶胞哪儿出了问题?

我自己直接把cif导入diamond,可画出来的和gujm516 网友画出来的就是不一样,不知道哪儿出了问题,请各位多多指教
附件1是我自己画的
附件2是gujm516 画的
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gujm516

金虫 (小有名气)

ICDS35335已经明确告知该空间群是一个伴有a,b方向滑移的素晶胞。
读入CIF时程序根据晶胞参数已自动确定空间群,不知为什么你还要再去选。
我把原先从你第一贴里下载的CIF传上,你把它复制到记事本里再试试。

data_35335-ICSD
#?2005 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
#Commerce on behalf of the United States.  All rights reserved.
_database_code_ICSD                35335
_audit_creation_date               1980/01/01
_audit_update_record               1998/06/29
_chemical_name_systematic          'Potassium Tecto-alumotrisilicate'
_chemical_formula_structural       'K (Al Si3 O8)'
_chemical_formula_sum              'Al1 K1 O8 Si3'
_chemical_name_mineral             Microcline
_publ_section_title
;
The crystal structure of maximum microcline
;
loop_
_publ_author_name                  'Brown, B.E.'
_cell_length_a                     8.573(4)
_cell_length_b                     12.983(7)
_cell_length_c                     7.220(3)
_cell_angle_alpha                  90.65(8)
_cell_angle_beta                   115.83(8)
_cell_angle_gamma                  87.70(8)
_cell_volume                       722.72
_cell_formula_units_Z              4
_symmetry_space_group_name_H-M     'C -1'
_symmetry_Int_Tables_number        2
_refine_ls_R_factor_all            .104
loop_
_symmetry_equiv_pos_site_id
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
  1        '-x, -y, -z'
  2        'x, y, z'
  3        '-x+.5, -y+.5, -z'
  4        'x+.5, y+.5, z'
loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_oxidation_number
Al3+          3
K1+           1
O2-           -2
Si4+          4
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_occupancy
_atom_site_attached_hydrogens
_atom_site_B_iso_or_equiv
K1 K1+ 4 i 0.7173 0.0072 0.8635 1. 0 0
Si1 Si4+ 4 i 0.0104 0.1875 0.2169 0.05 0 0.693
Si2 Si4+ 4 i 0.9903 0.1802 0.7673 0.97 0 0.351
Si3 Si4+ 4 i 0.711 0.1202 0.3309 0.99 0 0.341
Si4 Si4+ 4 i 0.2941 0.1144 0.6493 0.99 0 0.313
Al1 Al3+ 4 i 0.0104 0.1875 0.2169 0.95 0 0.693
Al2 Al3+ 4 i 0.9903 0.1802 0.7673 0.03 0 0.351
Al3 Al3+ 4 i 0.711 0.1202 0.3309 0.01 0 0.341
Al4 Al3+ 4 i 0.2941 0.1144 0.6493 0.01 0 0.313
O1 O2- 4 i 0.0007 0.1448 0.9831 1. 0 0.759
O2 O2- 4 i 0.6366 0.0058 0.2853 1. 0 0.667
O3 O2- 4 i 0.8202 0.1476 0.2205 1. 0 1.03
O4 O2- 4 i 0.1684 0.143 0.7584 1. 0 1.02
O5 O2- 4 i 0.0352 0.3203 0.2514 1. 0 0.77
O6 O2- 4 i 0.9634 0.3047 0.7311 1. 0 0.736
O7 O2- 4 i 0.1911 0.1229 0.4053 1. 0 0.973
O8 O2- 4 i 0.8247 0.1258 0.5873 1. 0 0.933

#End of data_35335-ICSD
8楼2008-08-22 18:34:01
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crystalsnet

新虫 (正式写手)

您是说您的晶胞外框不一样
还是说晶胞里的内容不一样?
2楼2008-08-22 08:54:47
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daxu

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by crystalsnet at 2008-8-22 08:54:
您是说您的晶胞外框不一样
还是说晶胞里的内容不一样?

我是说晶胞内容不一样,不是说键的形式和四面体什么的,光看钾就知道了,我画出来的钾原子只有上下底面有,而网友画出来的中间也有,所以自己也搞不清问题出在哪儿了
这是所需要的cif文件http://www.namipan.com/d/icsd353 ... 2ea6e1f5597990a0000
much to learn
3楼2008-08-22 09:27:44
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crystalsnet

新虫 (正式写手)

好像是不太一样,我和您得到的是一样的
您确定是这个文件吗?
4楼2008-08-22 09:56:52
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