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a15665819523

铜虫 (小有名气)

[求助] 为什么我的PCR结果总是不对?

最近我一直在做PCR,可是不管我怎么小心,结果总是出错,作为一个新人,我的信心完全被打击没了,我都对PCR产生恐惧了,这是什么原因呢?为什么我就总是做不出来,可是别人稍微一做,感觉都没怎么认真就做出了正确结果,这是为什么?
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要活得像毒品一样,要么惹不起,要么不能弃!
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tonganlhy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-23 22:54:42
a15665819523: 金币+1 2015-08-24 16:04:51
每次做的时候同时做正对照和负对照,便于分析原因
2楼2015-08-23 20:57:02
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半醒半梦

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-08-23 22:54:54
a15665819523: 金币+1 2015-08-24 16:04:36
a15665819523: 金币+3 2015-08-25 15:03:59
PCR结果不对是与自己预测的条带变大还是变小,最主要的原因是非特异性扩增。
1、产生非特异性扩增最主要原因是模板和引物不好,当引物原因排除了后,尽量用纯度高的模板,当然如果你用质粒作为模板,那随便扩都可以扩出来;
2、另外延伸时间也很重要,要选择合适的延伸时间,不能太长,也不能太短;
3、最后就是选择高保真和高效率的酶。
只要想起一生中后悔的事,梅花便落满了南山。
3楼2015-08-23 21:03:07
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我是鱼豆腐

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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西门吹雪170: 金币+5, 鼓励回帖交流 2015-08-23 22:55:13
a15665819523: 金币+2 2015-08-24 16:06:42
a15665819523: 金币+5 2015-08-25 15:04:11
同学没事,刚开始做分子生物实验的时候我们大家都是这样过来的,我之前也是pcr跑不出来看到电泳仪和pcr机器就苦恼,后来静下心来仔细分析找到问题出在哪里就好了,下面是我的一些经验,希望对你有用。
    1、PCR模板的问题。很多情况下我们提取的DNA浓度纯度虽然很好,但仍然跑不出来,这就有可能是震荡时时间过长,导致DNA变成小片段,所以你会遇到浓度不错,纯度也在1.8以上仍然跑不出来的情况,解决方法就是提取dna时注意不要太剧烈太长时间的震荡,改进你提取DNA的方法,记得最后稀释到10到100ng每微升就好。
   2、pcr条件问题。我们一般用的都是别人跑成功的引物,所以我们也会完全参照别人的pcr条件,如果跑不出来就需要确定在你的实验条件下的退火温度,建议跑梯度PCR,两两间隔两度,50~60摄氏度通常是,一次就能测出来最适合的退火温度。
   3、跑胶条件。太多的人跑出来的胶要么月牙型,要么牛角型,再要么就是缓冲液不及时换电泳仪不勤洗之类问题,反正只要是我跑电泳肯定要洗一次电泳仪的,最后用TBE润洗,还有我的条件是110v30min,跑出来很好,缓冲液建议用了7~8次后就换。
    4、再其他的问题就是仪器啊试剂方面的,你再多注意下,心细些就好。
    祝你好运~
4楼2015-08-23 21:19:31
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蓬山远音

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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a15665819523: 金币+1 2015-08-24 16:04:20
a15665819523: 金币+1 2015-08-25 15:04:22
有可能设计引物时有的需要补密码子,你看看有没有漏掉。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2015-08-24 07:53:26
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引用回帖:
4楼: Originally posted by 我是鱼豆腐 at 2015-08-23 21:19:31
同学没事,刚开始做分子生物实验的时候我们大家都是这样过来的,我之前也是pcr跑不出来看到电泳仪和pcr机器就苦恼,后来静下心来仔细分析找到问题出在哪里就好了,下面是我的一些经验,希望对你有用。
    1、PCR模 ...

6楼2015-08-24 15:09:58
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a15665819523

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tonganlhy at 2015-08-23 20:57:02
每次做的时候同时做正对照和负对照,便于分析原因

做了阴性对照,可奇怪的是,阴性对照没有条带,但是其他的也不该有条带的有了!而且不止一个。
要活得像毒品一样,要么惹不起,要么不能弃!
7楼2015-08-24 16:01:06
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a15665819523

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 半醒半梦 at 2015-08-23 21:03:07
PCR结果不对是与自己预测的条带变大还是变小,最主要的原因是非特异性扩增。
1、产生非特异性扩增最主要原因是模板和引物不好,当引物原因排除了后,尽量用纯度高的模板,当然如果你用质粒作为模板,那随便扩都可以 ...

我主要是做阴阳性检测,对条带大小要求不是很高,我的问题是该阴性的可能结果出现阳性,阳性的反而有事成了阴性
要活得像毒品一样,要么惹不起,要么不能弃!
8楼2015-08-24 16:02:58
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a15665819523

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 蓬山远音 at 2015-08-24 07:53:26
有可能设计引物时有的需要补密码子,你看看有没有漏掉。

引物应该没问题,就是做出该有的结果感觉像是小概率事件,一次一个结果的样子
要活得像毒品一样,要么惹不起,要么不能弃!
9楼2015-08-24 16:04:11
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a15665819523

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 我是鱼豆腐 at 2015-08-23 21:19:31
同学没事,刚开始做分子生物实验的时候我们大家都是这样过来的,我之前也是pcr跑不出来看到电泳仪和pcr机器就苦恼,后来静下心来仔细分析找到问题出在哪里就好了,下面是我的一些经验,希望对你有用。
    1、PCR模 ...

谢谢~
要活得像毒品一样,要么惹不起,要么不能弃!
10楼2015-08-24 16:06:33
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