应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 高通量测序数据拆分异常
51/1返回列表
查看: 2771  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)

[求助] 高通量测序数据拆分异常 已有2人参与

各位做过高通量测序的大侠：
      我刚刚学习使用高通量测序技术，是扩增子测序，菜鸟一个。之前送了一批样品，初步检测是合格的，但是过了没几天，测序公司说我的16个样品拆出的数据 都只有几百至几千条，按说初步样品检测浓度合格，下机拆分的数据量不会这么少，这样的数据根本没法进行后续分析，问我是不是提供的barcode信息有误，但是我核实了barcode都是正确的。
      但是公司也说不出其他原因，这么多样品都出问题，要是重做不仅浪费时间金钱，关键是样品放了那么久不知道能不能全部做出来了。头疼啊！指着这个毕业呢！！！
      请各位大侠指点迷津，这种数据拆分异常会是什么原因造成的？现在我该怎么办？
高手相助感激不尽！！！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高通量测序

» 猜你喜欢
越努力越幸运
1楼 2015-08-15 10:28:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by great07225388 at 2015-08-16 17:16:04
一般像扩增子测序，公司都有固定的流程，问题应该不大。建议看下究竟是测序的问题，还是建库的问题，还是样品制备的问题，等等。

现在就是找不到什么原因，样品交给公司测试就是有这个弊端，他们坚持说与我同批测试的其他人的样品都是正常的，也就是首先排除测序和建库有问题。如果样品制备有问题，那前期检测是合格的啊，还有问题的话，我就不知道怎么办了。全部重新做？能保证就正常吗？哎  头疼
赞一下 回复此楼
越努力越幸运
5楼2015-08-17 08:25:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

我是鱼豆腐

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-22 23:07:03
柠檬可乐星: 金币+2 2015-09-01 11:03:00
barcode不该是公司给出的么，你可以先查看一下公司给你的数据分析结果，应该有个质量报告什么的；如果你DNA检测浓度和纯度合格的话，公司检测应该是没问题的。
赞一下 回复此楼
2楼2015-08-16 15:07:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

great07225388

新虫 (著名写手)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-22 23:07:16
一般像扩增子测序，公司都有固定的流程，问题应该不大。建议看下究竟是测序的问题，还是建库的问题，还是样品制备的问题，等等。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
3楼2015-08-16 17:16:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 我是鱼豆腐 at 2015-08-16 15:07:31
barcode不该是公司给出的么，你可以先查看一下公司给你的数据分析结果，应该有个质量报告什么的；如果你DNA检测浓度和纯度合格的话，公司检测应该是没问题的。

公司一次给了很多barcode，自己扩增的时候使用了其中一部分，现在数据异常，公司怀疑是我提供给他们的我实验所用的barcode 信息有误。现在刚测完序，要下机拆分数据，结果就出现这种情况，公司觉得不正常，所以暂时没有往下进行，报告也没出
赞一下 回复此楼
越努力越幸运
4楼2015-08-17 08:22:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +14 chaojifeixia 2026-03-19 16/800 2026-03-23 17:45 by 材料学257求调剂
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +5 葵梓卫队 2026-03-18 7/350 2026-03-23 16:26 by lingjue
[考研] 招08考数学 +6 laoshidan 2026-03-20 14/700 2026-03-23 14:37 by 15614359529
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +3 Promise-jyl 2026-03-23 3/150 2026-03-23 13:43 by wangkm
[考研] 263求调剂 +6 yqdszhdap－ 2026-03-22 9/450 2026-03-23 12:57 by yqdszhdap－
[考研] 307求调剂 +11 冷笙123 2026-03-17 11/550 2026-03-22 20:16 by edmund7
[考研] 环境学硕288求调剂 +6 皮皮皮123456 2026-03-22 6/300 2026-03-22 16:52 by i_cooler
[考研] 305分求调剂（食品工程） +4 Sxy112 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:26 by 无懈可击111
[考研] 考研调剂 +4 来好运来来来 2026-03-21 4/200 2026-03-22 12:15 by 星空星月
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +4 NIFFFfff 2026-03-20 4/200 2026-03-22 09:49 by 2026paper
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 299求调剂 +4 某某某某位 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:30 by barlinike
[考研] 求调剂 +3 .m.. 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:25 by barlinike
[考研] 材料与化工（0856）304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿:南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +4 @taotao 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:14 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 求调剂 +3 eation27 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:32 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭