24小时热门版块排行榜    

查看: 1335  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

夏夜微风

木虫 (正式写手)

[求助] 融合PCR 已有2人参与

最近做了融合PCR,做了十多天。
三个片段①522bp,②1274bp,③587bp
引物①-F:cgcgatatcttatgtatgctcttctgacttttcg;①-R:gttatgcggccgctttgattgatttgactgtgttattttg
引物②-F:cgcaaaataacacagtcaaatcaatcaaagcggccgcataacttcgtataatgtatgctatacgaagttatcgttttaagagcttggtgagc;
       ②-R:tatacgaagttattgtgcggtatttcacaccgc
引物③-F:catatgcggtgtgaaataccgcacaataacttcgtataatgtatgctatacgaagttatccgcgggcgatttaatctctaattattag
       ③-R:cgcgatatctttcaatcattggagcaatcattttac
50ul反应体系:
5× Buffer(5mM Mg2+ plus)                    10ul
dNTP Mixture(2.5mM each)                     4.5ul
DNA polymerase(2.5unit/ul)                      0.5ul
模版1                                                            0.5ul
模版2                                                            0.5ul
模版3                                                             0.5ul
ddH2O                                                           33.5ul
PCR反应条件:
Volume:50ul
1. 98℃,10s
2. 98℃,10s
3. 51℃,3min
     +0.2℃ per cycle
     +12s per cycle
4. 72℃,2min30s
5. GOTO step2,10×
6. 72℃,10min
7. 4℃,∞
然后加引物①-F、③-R再PCR
PCR反应条件:
Volume:20ul
1. 94℃,30s
2. 94℃,30s
3. 53℃,1min
4. 72℃,3min
5. GOTO step2,27×
6. 72℃,10min
7. 12℃,∞
跑出来的条带在2300左右。但是胶回收在进行PCR验证时,却没有2300bp左右的条带了,这是为什么啊?
①-F×②-R;②-F×③-R;①-F×③-R三组引物进行PCR,但没有相应条带,这到底是为什么啊?
PCR反应条件:
Volume:20ul
1. 94℃,1min
2. 94℃,30s
3. 53℃,1min
4. 72℃,3min
5. GOTO step2,27×
6. 72℃,10min
7. 12℃,∞
回复此楼
还未成熟,就已老去!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chengjie0801

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

请问楼主的问题解决了吗? 我做的也是类似的项目。 我的融合反应使用的是普通PCR 设计,不是楼主梯度式扩增, 最后得到的是弥散的条带。 不知道是什么原因,请问楼主知道原因吗?
3楼2016-03-10 13:33:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

liygmail

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
片段2和片段3的引物不好,二级结构太多了
①-F×②-R以及②-F×③-R的融合PCR没有扩增出相应条带,多半原因在于引物
2楼2015-08-10 13:20:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏夜微风

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by chengjie0801 at 2016-03-10 13:33:23
请问楼主的问题解决了吗? 我做的也是类似的项目。 我的融合反应使用的是普通PCR 设计,不是楼主梯度式扩增, 最后得到的是弥散的条带。 不知道是什么原因,请问楼主知道原因吗?

我做出来了,重新设计的引物,两头的的做融合,再进行酶切连接把中间的连上
还未成熟,就已老去!
4楼2016-03-10 18:28:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 4/200 2026-11-15 14:11 by 0aDbZAghdVq9
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 4/200 2026-11-15 09:57 by xSrQNSSjcgoX
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 SX5mJmPWDfOO 2026-11-13 3/150 2026-11-15 08:40 by xSrQNSSjcgoX
[文学芳草园] 厉娜 +4 张丹枫1991 2026-11-09 6/300 2026-11-15 00:48 by Equinoxhua
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-15 00:35 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-13 11:04 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:48 by ECLTXnJnRSXf
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 8/400 2026-11-12 11:11 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 8/400 2026-11-12 11:00 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 7/350 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:36 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:27 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 7/350 2026-11-12 10:16 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 09:46 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 3/150 2026-11-12 08:26 by HajghKOMynmz
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cdqGD6ftHmbl 2026-11-11 3/150 2026-11-12 07:53 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 8/400 2026-11-12 05:08 by 9fOTqj074tIg
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 8/400 2026-11-12 04:57 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 4/200 2026-11-12 02:23 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 7/350 2026-11-12 00:44 by 9fOTqj074tIg
信息提示
请填处理意见