应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！
81/1返回列表
查看: 2381  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

speedking

木虫 (正式写手)

[求助] 建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！ 已有1人参与

小弟是用MEGA6.0建N-J系统发育树，我知道将序列放进软件比对后将两端截齐，可我这怎么截啊，前端和中间出现那么多缺失部分，那个用删除吗？下面3张图分别是前端、中间、尾部的截图，大家有没遇到过类似的问题，是什么原因，该怎么解决呢？另外，发文章时用Original tree还是Bootstrap consensus tree？在此先谢谢了！！

建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！
前端.png


建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！-1
尾部.png


建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！-2
中间.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
人生总会累的，现在不累，以后会更累！
1楼 2015-08-07 14:05:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

远望集团

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
出现缺失部分是因为个别序列在那个位置有碱基而其他大部分序列在那个位置没有碱基。
如果你要截去两端部分，一般得用序列编辑软件才行，直接在这里面是不行的。至于中间空位的问题，你是先用clustal 比对的吗，编辑里面有选择去除gaps的功能。然后保存比对结果，用MEGA打开。
另外，Original tree和Bootstrap consensus tree在文章中都有出现，一般是前者加注可信度值就行。
赞一下(3人) 回复此楼
只要努力，一切皆有可能！更美的风景在那片更高的天空。。。
2楼2015-08-08 10:17:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

speedking

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 远望集团 at 2015-08-08 10:17:43
出现缺失部分是因为个别序列在那个位置有碱基而其他大部分序列在那个位置没有碱基。
如果你要截去两端部分，一般得用序列编辑软件才行，直接在这里面是不行的。至于中间空位的问题，你是先用clustal 比对的吗，编辑 ...

我是直接用MEGA软件里的比对功能，比对完了就是我图中出现的结果。那我需要下载个clustal软件来比对并去除gaps吗？
赞一下 回复此楼
人生总会累的，现在不累，以后会更累！
3楼2015-08-08 11:59:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

远望集团

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
speedking: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-08-09 03:16:18
内容已删除
赞一下 回复此楼
只要努力，一切皆有可能！更美的风景在那片更高的天空。。。
4楼2015-08-08 20:18:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夕曼

新虫 (初入文坛)
借楼咨询下，为什么我用clustal x是老是显示conflicting sequence names:uncltured;names must be unique，根目录，文件名什么的都改成英文了
赞一下 回复此楼
5楼2016-03-28 21:23:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sherry_wang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 夕曼 at 2016-03-28 21:23:36
借楼咨询下，为什么我用clustal x是老是显示conflicting sequence names:uncltured;names must be unique，根目录，文件名什么的都改成英文了

请问你解决了么 我也遇到了同样的问题
赞一下 回复此楼
6楼2016-11-29 09:10:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吴晓雯

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sherry_wang at 2016-11-29 09:10:52
请问你解决了么 我也遇到了同样的问题...

请问大虾们问题解决了吗？我是小白，也遇到这问题，我不会处理，求帮助

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2017-06-21 21:55:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baozi93

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
8楼2018-10-22 15:25:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 speedking 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 08工学调剂 +12 用户573181 2026-03-20 17/850 2026-03-24 21:45 by 番茄炖了西红柿
[考研] 材料学硕，求调剂 6+3 糖葫芦888ll 2026-03-22 7/350 2026-03-24 17:11 by hello七七
[考研] 305分求调剂（食品工程） +5 Sxy112 2026-03-21 7/350 2026-03-24 12:27 by 544594351
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +18 chaojifeixia 2026-03-19 20/1000 2026-03-24 10:34 by dolphin_ycj
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +7 vv迷 2026-03-22 7/350 2026-03-23 23:44 by Txy@872106
[考研] 材料专硕英一数二306 +8 z1z2z3879 2026-03-18 8/400 2026-03-23 20:49 by baobaoye
[考研] 一志愿陕师大生物学071000，298分，求调剂 +3 SYA！ 2026-03-23 3/150 2026-03-23 19:09 by macy2011
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
[考研] 石河子大学（211、双一流）硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-20 3/150 2026-03-22 16:00 by ColorlessPI
[考研] 318求调剂 +4 plum李子 2026-03-21 7/350 2026-03-22 14:17 by ColorlessPI
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 0805材料320求调剂 +3 深海物语 2026-03-20 3/150 2026-03-21 15:46 by 无际的草原
[考研] 274求调剂 +10 S.H1 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:51 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭