应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！
51/1返回列表
查看: 2387  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

speedking

木虫 (正式写手)

[求助] 建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！ 已有1人参与

小弟是用MEGA6.0建N-J系统发育树，我知道将序列放进软件比对后将两端截齐，可我这怎么截啊，前端和中间出现那么多缺失部分，那个用删除吗？下面3张图分别是前端、中间、尾部的截图，大家有没遇到过类似的问题，是什么原因，该怎么解决呢？另外，发文章时用Original tree还是Bootstrap consensus tree？在此先谢谢了！！

建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！
前端.png


建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！-1
尾部.png


建系统发育树出现问题，请大虾们进来看看！！-2
中间.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
人生总会累的，现在不累，以后会更累！
1楼 2015-08-07 14:05:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

speedking

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 远望集团 at 2015-08-08 10:17:43
出现缺失部分是因为个别序列在那个位置有碱基而其他大部分序列在那个位置没有碱基。
如果你要截去两端部分，一般得用序列编辑软件才行，直接在这里面是不行的。至于中间空位的问题，你是先用clustal 比对的吗，编辑 ...

我是直接用MEGA软件里的比对功能，比对完了就是我图中出现的结果。那我需要下载个clustal软件来比对并去除gaps吗？
赞一下 回复此楼
人生总会累的，现在不累，以后会更累！
3楼2015-08-08 11:59:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

远望集团

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
出现缺失部分是因为个别序列在那个位置有碱基而其他大部分序列在那个位置没有碱基。
如果你要截去两端部分，一般得用序列编辑软件才行，直接在这里面是不行的。至于中间空位的问题，你是先用clustal 比对的吗，编辑里面有选择去除gaps的功能。然后保存比对结果，用MEGA打开。
另外，Original tree和Bootstrap consensus tree在文章中都有出现，一般是前者加注可信度值就行。
赞一下(3人) 回复此楼
只要努力，一切皆有可能！更美的风景在那片更高的天空。。。
2楼2015-08-08 10:17:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夕曼

新虫 (初入文坛)
借楼咨询下，为什么我用clustal x是老是显示conflicting sequence names:uncltured;names must be unique，根目录，文件名什么的都改成英文了
赞一下 回复此楼
5楼2016-03-28 21:23:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sherry_wang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 夕曼 at 2016-03-28 21:23:36
借楼咨询下，为什么我用clustal x是老是显示conflicting sequence names:uncltured;names must be unique，根目录，文件名什么的都改成英文了

请问你解决了么 我也遇到了同样的问题
赞一下 回复此楼
6楼2016-11-29 09:10:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
[考研] 303求调剂 +3 蓝山月 2026-03-25 3/150 2026-03-25 10:04 by 雾散后相遇lc
[考研] 考研调剂 +4 呼呼？~+123456 2026-03-24 4/200 2026-03-24 23:16 by barlinike
[考研] 一志愿北化315 求调剂 +3 akrrain 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:35 by 了了了了。。
[考研] 材料专硕找调剂 +5 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:07 by 了了了了。。
[考研] 材料考研调剂生 +3 黄粱一梦千年 2026-03-24 3/150 2026-03-24 17:00 by barlinike
[考研] 300求调剂，材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[考研] 【双一流院校新能源、环境材料，材料加工与模拟招收大量调剂】 +4 Higraduate 2026-03-22 7/350 2026-03-24 11:23 by 种大树
[考研] 327求调剂 +5 prayer13 2026-03-23 5/250 2026-03-23 22:11 by 星空星月
[考研] 化学308分求调剂 +3 你好明天你好 2026-03-23 3/150 2026-03-23 20:11 by macy2011
[考研] 323求调剂 +6 洼小桶 2026-03-18 6/300 2026-03-23 00:29 by king123！
[考研] 一志愿东华大学化学070300，求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿深大，0703化学，总分302，求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +8 小材化本科 2026-03-18 8/400 2026-03-20 23:16 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭