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比永远都要远

新虫 (初入文坛)

[求助] 一种DNA一种引物PCR之后是不是只用一个条带? 已有3人参与

使用一个DNA样品,一种引物,进行PCR扩增(设置8个温度梯度),120V电压,70min,照胶出来就只有一个条带,我的结果有问题吗?

一种DNA一种引物PCR之后是不是只用一个条带?
PCR.jpg
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-05 23:00:17
你这个图看起来并不是一条带,是弥散带。另外你的DNA是基因组DNA?
2楼2015-08-05 21:52:47
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比永远都要远

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-08-05 21:52:47
你这个图看起来并不是一条带,是弥散带。另外你的DNA是基因组DNA?

是的我的DNA 是基因组DNA ,那什么原因产生的弥散呢?
3楼2015-08-07 11:24:15
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 比永远都要远 at 2015-08-07 11:24:15
是的我的DNA 是基因组DNA ,那什么原因产生的弥散呢?...

基因组DNA用单引物扩,扩出来的是一系列长度不一致的片段,所以应该是弥散带。
4楼2015-08-07 21:43:41
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比永远都要远

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2015-08-07 21:43:41
基因组DNA用单引物扩,扩出来的是一系列长度不一致的片段,所以应该是弥散带。...

您的意思是说我加的是单引物?


还有我做了一个稀释DNAD浓度的对比试验跑出来结果是这样的,中间跑出来的条带的是一个稀释浓度
一种DNA一种引物PCR之后是不是只用一个条带?-1
2015年8月6号降低模板DNA浓度出现条带.jpg

5楼2015-08-08 14:51:37
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
比永远都要远: 金币+10 2015-08-11 13:00:48
引用回帖:
5楼: Originally posted by 比永远都要远 at 2015-08-08 14:51:37
您的意思是说我加的是单引物?


还有我做了一个稀释DNAD浓度的对比试验跑出来结果是这样的,中间跑出来的条带的是一个稀释浓度

2015年8月6号降低模板DNA浓度出现条带.jpg
...

哦,你说的一种引物是指一对引物,是吗?我理解错了,还以为你用的一条引物扩增的。从你后面这个图看,应该是DNA浓度过高,既然稀释后扩出来了就用稀释后的扩,一般DNA模板量在10-200ng范围内。
6楼2015-08-10 10:08:14
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

产生弥散的原因有很多,你这个估计是样品吧酶处理好 看看这篇文章,有解决弥散提高特异性的不错http://www.detaibio.com/topics/pcr-faq-specific-amplify.html
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
7楼2015-08-10 10:52:33
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fly_锋

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

其实楼主的第一张图,是在不同温度下的结果,跑出这样其实是算不错的,结果表明第三个孔的温度是最适合你的引物的。这个类似于筛选最佳温度。另外最后两个孔在较高位置好像也出现条带,你得根据产物大小,确定下,到底那个是你要的。至于降解拖带这个问题,有好多解释,看你后续做什么了,如果就是测个序什么的,这也是没有问题的
。希望可以帮到你!
8楼2015-08-10 11:01:06
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