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clareleelove主管区长
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Amber如何处理琥珀酸酐修饰酶上面的lys残基
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首先,先谢谢各位大神了。万分感激!!! 结合Gaussian和antechamber,生成了琥珀酸酐的拓扑和参数文件。我在想,按照Amber官网B4教程后半部分,生成琥珀酸酐和酶的体系,先能量最小化,再升温平衡,然后用bond连接琥珀酸酐和酶上面的lys残基,由于根据实验有四个lys残基发生反应,所以我打算重复上述步骤,将4个lys残基与琥珀酸酐反应,这样是否可行? |
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