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clareleelove

铜虫 (小有名气)

[求助] Amber如何处理琥珀酸酐修饰酶上面的lys残基

首先,先谢谢各位大神了。万分感激!!!

结合Gaussian和antechamber,生成了琥珀酸酐的拓扑和参数文件。我在想,按照Amber官网B4教程后半部分,生成琥珀酸酐和酶的体系,先能量最小化,再升温平衡,然后用bond连接琥珀酸酐和酶上面的lys残基,由于根据实验有四个lys残基发生反应,所以我打算重复上述步骤,将4个lys残基与琥珀酸酐反应,这样是否可行?
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clareleelove

铜虫 (小有名气)

怎么没有人回答我呢
2楼2015-08-03 15:49:24
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