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clareleelove铜虫 (小有名气)
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Amber如何处理琥珀酸酐修饰酶上面的lys残基
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首先，先谢谢各位大神了。万分感激！！！ 结合Gaussian和antechamber，生成了琥珀酸酐的拓扑和参数文件。我在想，按照Amber官网B4教程后半部分，生成琥珀酸酐和酶的体系，先能量最小化，再升温平衡，然后用bond连接琥珀酸酐和酶上面的lys残基，由于根据实验有四个lys残基发生反应，所以我打算重复上述步骤，将4个lys残基与琥珀酸酐反应，这样是否可行？ |
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clareleelove
铜虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
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- 虫号: 1361852
- 注册: 2011-08-05
- 性别: MM
- 专业: 微生物生理与生物化学
2楼2015-08-03 15:49:24