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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » PBS脚本提交任务，不能计算，一直处于等待状态
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chengaoyuan

铜虫 (小有名气)

[求助] PBS脚本提交任务，不能计算，一直处于等待状态 已有4人参与

最近新购置的机器，刚刚安装好VASP，发现用PBS提交，一提交就出现Q这样的排队状态，前面根本没有人计算，只有我自己呀？
求高人指点一下，我对于这个不熟悉，是新手。 下面是脚本内容

#PBS -N vasp
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -j oe
#PBS -l walltime=1000:00:00

cd $PBS_O_WORKDIR
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP /public/software/vasp/5.3.3/vasp  >&vasp.log
~

PBS脚本提交任务，不能计算，一直处于等待状态
360截图20150721173124337.jpg
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1楼 2015-07-21 17:41:14
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bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:22
1) 什么配置，什么CPU？
2）其它软件试了没有？能不能正常提交作业？
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2楼2015-07-21 18:53:46
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wmy8802217

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:27
是不是你机子还有在运行什么，照成十六个核没有完全空闲，所以没运行任务？
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凝聚态理论与计算物理
3楼2015-07-22 08:18:07
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chengaoyuan

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bluewhale at 2015-07-21 18:53:46
1) 什么配置，什么CPU？
2）其它软件试了没有？能不能正常提交作业？

目前比较熟悉这个，其他的软件没有测试
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4楼2015-07-22 09:08:38
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chengaoyuan

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wmy8802217 at 2015-07-22 08:18:07
是不是你机子还有在运行什么，照成十六个核没有完全空闲，所以没运行任务？

所有的没有任务进行。另外总共有8个节点的，每一个16个核。
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5楼2015-07-22 09:10:29
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chengaoyuan

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bluewhale at 2015-07-21 18:53:46
1) 什么配置，什么CPU？
2）其它软件试了没有？能不能正常提交作业？

是曙光的机子
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6楼2015-07-22 09:12:10
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wmy8802217

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:46
SSH到每个节点上top一下。。看看里面有没有占CPU内存的进程
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凝聚态理论与计算物理
7楼2015-07-22 09:35:08
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刘仕晨

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:52
你可以pbsnodes看下，所有节点的信息，他们的状态是不是free，我估计你的状态是down，没有安装配置好pbs，或者没有启动起来。
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8楼2015-07-22 10:20:21
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hs0218

金虫 (正式写手)

DDr.

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:57
set queue batch resources_default.walltime = 720:00:00


你查看下pbs的默认最大时间是720h。你的是不是超时的原因
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路漫漫其修远兮
9楼2015-07-22 23:41:04
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王文平wp

新虫 (初入文坛)
您好！我想问一下你这个问题怎么解决的 我也遇到了同样的问题 节点是free的 但是提交后就一直处于排队状态
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10楼2015-12-03 17:52:52
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