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chengaoyuan

铜虫 (小有名气)

[求助] PBS脚本提交任务,不能计算,一直处于等待状态 已有4人参与

最近新购置的机器,刚刚安装好VASP,发现用PBS提交,一提交就出现Q这样的排队状态,前面根本没有人计算,只有我自己呀?
求高人指点一下,我对于这个不熟悉,是新手。 下面是脚本内容

#PBS -N vasp
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -j oe
#PBS -l walltime=1000:00:00

cd $PBS_O_WORKDIR
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP /public/software/vasp/5.3.3/vasp  >&vasp.log
~

PBS脚本提交任务,不能计算,一直处于等待状态
360截图20150721173124337.jpg
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bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:22
1) 什么配置,什么CPU?
2)其它软件试了没有?能不能正常提交作业?
2楼2015-07-21 18:53:46
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wmy8802217

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:27
是不是你机子还有在运行什么,照成十六个核没有完全空闲,所以没运行任务?
凝聚态理论与计算物理
3楼2015-07-22 08:18:07
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chengaoyuan

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bluewhale at 2015-07-21 18:53:46
1) 什么配置,什么CPU?
2)其它软件试了没有?能不能正常提交作业?

目前比较熟悉这个,其他的软件没有测试
4楼2015-07-22 09:08:38
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chengaoyuan

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wmy8802217 at 2015-07-22 08:18:07
是不是你机子还有在运行什么,照成十六个核没有完全空闲,所以没运行任务?

所有的没有任务进行。另外总共有8个节点的,每一个16个核。
5楼2015-07-22 09:10:29
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chengaoyuan

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bluewhale at 2015-07-21 18:53:46
1) 什么配置,什么CPU?
2)其它软件试了没有?能不能正常提交作业?

是曙光的机子
6楼2015-07-22 09:12:10
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wmy8802217

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:46
SSH到每个节点上top一下。。看看里面有没有占CPU内存的进程
凝聚态理论与计算物理
7楼2015-07-22 09:35:08
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刘仕晨

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:52
你可以pbsnodes看下,所有节点的信息,他们的状态是不是free,我估计你的状态是down,没有安装配置好pbs,或者没有启动起来。
8楼2015-07-22 10:20:21
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hs0218

金虫 (正式写手)

DDr.

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:28:57
set queue batch resources_default.walltime = 720:00:00


你查看下pbs的默认最大时间是720h。你的是不是超时的原因
路漫漫其修远兮
9楼2015-07-22 23:41:04
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王文平wp

新虫 (初入文坛)

您好!我想问一下你这个问题怎么解决的 我也遇到了同样的问题 节点是free的 但是提交后就一直处于排队状态
10楼2015-12-03 17:52:52
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