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sundan611

铁虫 (小有名气)

[求助] 荧光定量PCR引物的选择

植物细胞提取RNA反转后用自己设计的引物做PCR,准备摸好条件测序确定为目的基因后交给其他公司做荧光定量,
现在遇到的问题是:
1.扩增目的片段为100bp,总是有比100bp大的其他非特异片段干扰,我该如何优化条件?
2.我的样本有两种,一种是经过光照,另一种为不经光照,用同样的条件同样的引物扩增同一个基因,但是亮度却不一样,比如都是同一个基因,同一对儿引物结果他俩的退火温度却不太一致,一个样本退火温度为64度是条带很亮,而另个样本却在50多度条带很亮,64度反而不亮,这是正常的吗?如图左面数第五个孔就是光照样本64度扩增的,同样的条件左面数最后一个孔就是不经光照64度扩增的,条带就不亮,我做定量究竟应该选哪个温度呢?


3.另外我该选择什么样的PCR条件才能保证定量结果的准确性?比如条带单一,扩增的很亮?还是不需要很亮,只需要扩增出条带就可以了?

荧光定量PCR引物的选择
20150702-4.jpg
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sundan611

铁虫 (小有名气)

为什么没人回复呢?
2楼2015-07-23 11:06:12
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