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dongdong00

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】凝胶电泳:为什么制出来的胶会这样

由于目标蛋白的分子量大约在8 kDa ,为了分离这些蛋白,我想选择尝试用20%的分离胶。但是在制胶的过程中,发现制出来的胶和玻璃板之间总是会出现一些气泡状花纹(道胶的时候没有气泡),看起来似乎是胶和玻璃板贴合的不紧密。这些气泡开始的时候没有,但是聚合5分钟左右就开始出现,而且越来越多。一般在玻璃板的两边开始出现。做了好多次都是这样,不知道是什么原因。请大家帮忙分析一下。谢谢!
其中分离胶的配置:
H2O(ml)                       1.6
30%丙烯酰胺        13
1.5mol/lTrisHCl
(PH8.8) (ml)        5
10%SDS(ml)        0.2
10%AP(ml)                       0.2
TEMED(μl)                        7
总体积(ml)                       20

[ Last edited by dongdong00 on 2008-7-31 at 16:59 ]
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chysx6

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★ ★
dongdong00(金币+3,VIP+0):我觉得你分析的很对,我做了各种比例的胶,发现胶浓度越大,产生那样的花纹就会越多。谢谢你的意见,我会尝试一下的
从楼主描述的情况看应该是因为胶浓度太大,在胶凝固过程中体积缩小,导致与玻璃板分离所致。
这种情况下,胶一般是可以用的(我们配的胶偶尔出现这样情况,基本无影响)

建议:如果想分离这种目标蛋白,必然要在有限的胶长度上提高分辨率,而提高分辨率的方法不能一味的提高胶浓度。有一种办法是配制正常15%分离胶,但配方中的水用等量的甘油替换,楼主不妨试试,可以达到意想不到的效果。(有什么细节不清楚的,欢迎与我共同探讨)
3楼2008-08-01 01:59:23
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


dongdong00(金币+1,VIP+0):谢谢。
1、加了AP和TEMED之后要剧烈震荡(之前也要震荡几下),因为聚合的时候是排气的过程。我用50ml的离心管来配胶,所以震荡起来很方便
2、是不是玻璃板没有硅化好?
2楼2008-07-31 21:31:25
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


dongdong00(金币+1,VIP+0):谢谢。
其实,15%的胶已经够浓了,连小分子RNA都能分离,更何况是8kD的蛋白
4楼2008-08-01 09:01:49
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hu6704526

银虫 (小有名气)

按楼主的情况来看,我觉得分离这么大的蛋白质的话可以利用一个梯度的凝胶会好点,节省电泳的时间啊,而且效果也不错的。有关气泡我也遇到过,可能也是如上面所说的是浓度太大的原因,其实分离8K的没有必要用那么大浓度的
5楼2008-08-01 22:58:08
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