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gx730

金虫 (正式写手)

[求助] 帮忙分析一些分子的静电势和分子轨道图。。非常感谢已有1人参与

我分析醋酸乙烯分子结构中的碳碳双键和酯基氧原子的共轭效应。
通过高斯得到了该分子的静电势图和分子轨道图，如下。但是不知道怎么分析。
还有分子的HOMO轨道图，觉得好怪异，怎么是这个形状，感觉还有一块布折叠出一个洞一样，这样的形状有什么特殊的含义吗？
对高斯不做深入研究，只为得到一个结论，希望大侠们能够详细为我解答，金币不够还可以续加。非常感谢。

帮忙分析一些分子的静电势和分子轨道图。。非常感谢
homo轨道图.JPG


帮忙分析一些分子的静电势和分子轨道图。。非常感谢-1
lomo轨道侧视图.JPG


帮忙分析一些分子的静电势和分子轨道图。。非常感谢-2
醋酸乙烯静电势图.JPG
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1楼2015-06-24 11:03:21
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zhou2009

版主 (著名写手)
图1，electrostatic popential from total scf density。静电势的数值比电子密度的值要大好几个数量级，如果静电势等值面值按电子密度的值取得太小，就会出现这种怪图。GV静电势作图处有一个比例因子，如取0.01，它将静电势的数值统一缩小，才会正确，像图2那样。
图2，上次已经说了，静电势图表明：羰基氧处为负值，此处电子易给出，比如形成氢键。其它各处都比较稳定。
静电势图也是分子外表整体的反应性、活性，不能反映双键碳和烯酯氧的共轭等性质。
双键碳和烯酯氧的共轭还是要找HOMO以下的轨道，那里就有双键碳和烯酯氧的共轭的轨道，是哪一个还要具体去查找。
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gx730
7楼2015-06-25 09:07:08
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2015-06-24 17:09:02
gx730: 金币+50, ★★★很有帮助, 谢谢您的帮助。请问那我应该从什么方便分析醋酸乙烯分子碳碳双键和酯氧原子的共轭？ 还有就是如何分析醋酸乙烯分子的色散力，分子间的相互作用？醋酸乙烯的静电势图看出羰基氧比较活泼，那这个分子能够形成氢键吗，如何判定。 2015-06-24 17:34:05
gx730: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 谢谢 希望再给点建议 2015-06-24 21:38:11
1、图1HOMO轨道图没有正确作出。此图这个样子，因有错不能说明什么问题。
2、图2标示“lomo轨道侧视图”，是LUMO吗？我感到似乎这才是HOMO。它除了表明>C=O与=CH-O-有点共轭外，其它都是反相位、反键的。
3、分子的成键性质，像碳碳双键和酯基氧原子的共轭效应，作为共轭效应，它的能级较低，并不一定在HOMO。HOMO、LUMO都不能看到像碳碳双键和酯基氧原子的共轭效应，而是出现在HOMO以下的轨道。
4、图3静电势图表明：羰基氧处为负值，此处电子易给出，比如形成氢键。其它各处都比较稳定。
5、对于MO，HOMO、LUMO并不能表达分子的全面性质，它只是表明分子的反应性、活性。对于分子的其它性质，如单键、双键、碳碳双键和酯基氧原子的共轭效应等，它们的MO能级都很低，都在HOMO之下，与HOMO不同，不能通过HOMO来分析它们。
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gx730
2楼2015-06-24 11:54:16
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gx730

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2015-06-24 11:54:16
1、图1HOMO轨道图没有正确作出。此图这个样子，因有错不能说明什么问题。
2、图2标示“lomo轨道侧视图”，是LUMO吗？我感到似乎这才是HOMO。它除了表明>C=O与=CH-O-有点共轭外，其它都是反相位、反键的。
3、分 ...

谢谢您。
图1HOMO轨道图 我就是在.chk高斯优化后的分子.chk文件上，在GaussianViews 里的results-surface and contours-new cube里得到的，出来的就是这个样子。这三个图都是在一个分子.chk文件上上得到的。
为什么会出现这个问题呢？是软件的问题还是优化结构的时候没有优化好？
假如想从量化角度分析双键碳和烯酯氧的共轭，应该从什么角度进行分析？
还有就是可以从什么方面对醋酸乙烯的范德华相互作用进行研究？
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3楼2015-06-24 17:41:01
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gx730

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2015-06-24 11:54:16
1、图1HOMO轨道图没有正确作出。此图这个样子，因有错不能说明什么问题。
2、图2标示“lomo轨道侧视图”，是LUMO吗？我感到似乎这才是HOMO。它除了表明>C=O与=CH-O-有点共轭外，其它都是反相位、反键的。
3、分 ...

我又从新做了一下 分子的轨道图，那个图2 显示的还是LOMO轨道。 从新得到的HOMO轨道图像好像正常了，上传在这里，您帮我分析一下好吗？
这个HOMO 和LOMO 我分不清楚，我就是按照图中选择名称来定义的。
帮忙分析一些分子的静电势和分子轨道图。。非常感谢-3
HOMO侧视图.JPG


帮忙分析一些分子的静电势和分子轨道图。。非常感谢-4
homo俯视图.JPG
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4楼2015-06-24 17:58:40
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