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propamidine

铁杆木虫 (著名写手)


[求助] 关于使用SPSS进行EC50的计算问题 已有1人参与

本人之前进行杀菌剂EC50的计算,是根据师兄留下来的Excel表,照猫画虎的填数据计算,从未仔细思考过其计算原理或公式来源。
近日看了篇文献"J.-L. Li, X.-Y. Liu, J.-T. Xie, et al. A Comparison of Different Estimation Methods for Fungicide EC50 and EC95 Values. Journal of Phytopathology, 2015. 163(4):239-244."
这文章对常用的生测数据统计软件(如SPSS、DPS、GraphPad、Excel等)进行了比较,指出进行EC50计算和EC95时,Excel很不准确,应使用SPSS、DPS和GraphPad。
文献里对生测数据的统计也以SPSS为多,所以本人想用SPSS进行数据分析。
但搜不到计算杀菌剂EC50的中文文献,而多为杀虫剂LD50的文献,如:"齐军山, 辛志梅, 李林, 等. 应用SPSS软件进行农药试验数据的统计分析. 山东农业科学, 2008. 7:100-104."
按理说EC50和LD50的算法相似,大概知道怎么在SPSS输入数据进行计算了。
之后又查了不少资料,却越发糊涂。
(1)好像EC50的估算方法有很多种,见:"赵劲松, 于书霞. 利用概率单位法估算EC50的研究. 生态毒理学报, 2010. 420-425."
(2)Probit、ANOVA的关系和区别也搞的我很糊涂?
(3)外文文献的很多结果,就是毒力方程、EC50、95%置信限和相关系数。但我们老师说不要相关系数,要卡方值。卡方检验是否应该用适合性检验,以比较测定值与理论值是否符合,即毒力方程是否可信?

如果需要得到毒力方程、EC50、95%置信限、相关系数和卡方值,在SPSS进行数据处理是否分为不同部分进行?
哪位虫友可热心制作一份操作指南?定重金酬谢。

附上几组校正抑制率数据:
药剂浓度(mg/L)
320
160
80
40
20
10
5

药剂A校正抑制率
81.08
75.94
67.16
56.03
48.11
14.91
5.71

药剂B校正抑制率
73.37
70.38
66.09
62.67
56.24
27.12
8.06

[ Last edited by propamidine on 2015-6-16 at 21:56 ]
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propamidine

铁杆木虫 (著名写手)


送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhenguoyan at 2015-06-18 14:10:12
得到R平方要开方才是是相关系数R。
直接在SPSS里设置输出结果的小数位数的,我也不清楚
不过,可以把想要的表复制出来,贴到Excel中,就可以看到了,想要几位小数就保留几位。...

你好!非常感谢帮助。
方便的话,能否讲解一下ANOVA、 logit analysis和probit的区别?我在有的文献里看到计算EC50或者IC50用的是前两种方法。
另外,GraphPad做dose-response分析求EC50,你是否也比较熟悉?网上有教程是GraphPad5.0的,我用来绘图的是GraphPad 6.03。因为软件视窗变化比较大,所以看的比较糊涂。网上的视频教程也多是针对5.0的。
7楼2015-06-18 21:28:44
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zhenguoyan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
propamidine: 金币+30, ★★★很有帮助, 感谢帮助,请麻烦再看一下我数据统计的结果是否正确。另外,相关系数在哪里找的到? 2015-06-17 16:17:30
既然齐军山等发表的文章,那恭喜你已经找到了方法。
首先,SPSS计算害虫的LC50需要的变量有:药剂浓度、总虫数、死虫数
那么对应到菌上,抑菌试验的话,可以总的菌当做100%,然后抑菌率当做死亡的部分。所以得到以下对应:
药剂浓度
总虫数-------100
死虫数-------抑菌率
比如药剂A,浓度输在第一列,第二列总虫数为100,第三列死虫数为相应的抑菌率。就可以计算出来了。
另外,毒力方程、EC50、95%置信限、相关系数和卡方值,是一次性出来的。
如果是棵小草,即使在最好的地方,你也长不成大树。果真如此,不如历经风雨,把自己培养成名贵花卉。
2楼2015-06-17 08:19:15
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propamidine

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by zhenguoyan at 2015-06-17 08:19:15
既然齐军山等发表的文章,那恭喜你已经找到了方法。
首先,SPSS计算害虫的LC50需要的变量有:药剂浓度、总虫数、死虫数
那么对应到菌上,抑菌试验的话,可以总的菌当做100%,然后抑菌率当做死亡的部分。所以得到以 ...

你好!
按照文献方法,我下面如图的操作是否正确?
关于使用SPSS进行EC50的计算问题
0001.jpg


关于使用SPSS进行EC50的计算问题-1
0002.jpg


关于使用SPSS进行EC50的计算问题-2
0003.jpg


关于使用SPSS进行EC50的计算问题-3
0004.jpg


关于使用SPSS进行EC50的计算问题-4
0005.jpg

3楼2015-06-17 16:08:45
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propamidine

铁杆木虫 (著名写手)


上面的数据处理以药剂A为例。

毒力方程:y=-2.072+1.283x
EC50=41.247 mg/L  95%置信限24.150~69.915
卡方值X2=20.501  当自由度为5时,查X2表,p=0.05时,X2=11.07        20.501>11.07,表示差异不显著,所得方程y=-2.072+1.283x是符合实际的。

以上对结果的基本表述没有问题吧?

另外,相关系数在probit结果里找不到啊?
4楼2015-06-17 16:15:11
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