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zong7699

金虫 (小有名气)

[求助] 使用OriginPro 8进行Logistic回归时,怎么显示ED50和95%置信区间?

我监测杂草抗药性,是根据不同药剂浓度,得到芽长长度不同,算出抑制率,进行双逻辑非线性回归模型进行分析,
目前在学习使用OriginPro 8,抗性实验数据的分析用到Logistic回归,
模型:y=A2+(A1-A2)/[1+(X/Xo )^p],但是我输入数据计算后不显示ED50和95%置信区间。求指点怎么操作OriginPro 8!
如下方2组数据:左边的是一组浓度对数,X;右边是一组抑制率*100,Y ;求帮忙指点,怎样使用Origin 8计算,得到ED50和95%置信区间。
2.097         8.19
2.398        14.68
2.699        27.50
3.000        42.26
3.301        70.23

感激不尽!!!!拜谢!!!!!

我是这样分析的:Analysis - Fitting - Nonlinear Curve Fit - Open Dialog
Category:Growth/Sigmoidal ;Function:Logistic - 点Fit
得到如下结果
Value           Standard Error
1.6627           10.22967                 A1
35620.58    1.78384E7               A2
11.22509    1113.46487             Xo
5.11149           4.47267                   p

求指教,这样计算是否正确?如果不对应该怎么设定?如何得出95%置信区间和ED50?

再次拜谢各位大神!!!

[ 来自科研家族 快乐家族 ]
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好好学习,天天向上
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xiemingya

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zong7699: 金币+5, ★★★很有帮助, 十分感谢!有2个疑问:其一,按照你的方法勾选了95置信区间 2013-05-12 11:59:57
csgt0: 金币+1, 谢谢 2013-05-14 15:47:22
我用你的数据进行了试验,个人感觉结果没有问题。
对于置信区间,默认的是95%,可以修改,在Open Dialog的对话框,Settings----Fittde Curves-----Fittde Curve Plot-----Confidence level for Curves。这里可以显示的。
对于ED50,这里面是没有的,我查了Origin的帮助,里面就没有这个概念,而这个回归结果中有EC50,不知道二者可否替换。
以下是我百度的这二者的概念,个人感觉是可以替换的,至少是有关系的,
ED50:半数有效量(50% effective dose, ED50)在量反应中指能引起50%最大反应强度的药量,在质反应中指引起50%实验对象出现阳性反应时的药量。
EC50,半最大效应浓度(concentration for 50% of maximal effect,EC50)是指能引起50%最大效应的浓度。LD50/ED50、TD50/ED50、TC50/EC50等统称为治疗指数,是一类药物的安全指标,通常其值越大越安全。需注意这些指标只反映治疗作用与急性毒性的关系,并不能反映慢性毒性、过敏性。
2楼2013-05-12 10:03:32
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xiemingya

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


csgt0: 金币+1, 谢谢 2013-05-14 15:47:31
这是我试验过程的图片,供你参考,

捕获.PNG



捕获2.PNG

3楼2013-05-12 10:06:44
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zong7699

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiemingya at 2013-05-12 10:03:32
我用你的数据进行了试验,个人感觉结果没有问题。
对于置信区间,默认的是95%,可以修改,在Open Dialog的对话框,Settings----Fittde Curves-----Fittde Curve Plot-----Confidence level for Curves。这里可以显 ...

十分感谢!有2个疑问:

其一,按照您的方法勾选了95%置信区间后,在输出的结果中,并未显示出95%置信区间是多少,只是在Fitted Curves Plot的曲线图中,回归曲线的两边把置信限的范围用曲线表示了出来。
简言之就是按你的方法勾选后,只是图片变化,数据还是没有。
我需要得到EC50的95%置信区间的具体数值。

其二,不知道我跟您的操作哪里有所不同,Category:Growth/Sigmoidal ;Function:Logistic选定之后,出的结果只有A1、A2、X0、p,没有EC20、50、80
这是为什么?在哪里勾选显示出EC50?

注:我使用GraphPad Prism 6 进行Logistic回归,得出EC50为1122,事实上是用Excel进行线性回归的结果也是1109,哪怕不用任何软件,光看数据也能知道抑制中浓度是1000多,因为浓度为1000的时候,对数为3.0000,(我是把浓度化为对数值了),抑制率到了42.26%了,显然再高一些就是EC50了。所以得出只有几十肯定不对。

置信区间以曲线显示出来了.jpg



未见EC20、50、80.jpg

好好学习,天天向上
4楼2013-05-12 12:18:57
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xiemingya

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


csgt0: 金币+1, 谢谢 2013-05-14 15:47:42
对于置信区间的问题,我不知道,你是想得到参数的置信区间的数值呢,还是想得到表示y的量的置信区间的数值。对于参数的,见下图0、1,对于y的,见下图22、33、44.
对于,你说的,EC50如何显示的问题,我只能说,我用的是8.5,它是作为参数自动输出的。所以,我猜测是版本的问题,这个,我也搞不懂,至于你后面说的数值的大小问题,我就不懂了,我只知道可以这么操作。
帮不了你太多了,只能再坐等高人了。

0.PNG



1.PNG



22.PNG



33.PNG



44.PNG

5楼2013-05-12 19:18:38
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zong7699

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xiemingya at 2013-05-12 19:18:38
对于置信区间的问题,我不知道,你是想得到参数的置信区间的数值呢,还是想得到表示y的量的置信区间的数值。对于参数的,见下图0、1,对于y的,见下图22、33、44.
对于,你说的,EC50如何显示的问题,我只能说,我 ...

十分感谢!
1、公式当中的X0其实就是EC50值。也就是其实我的8.0也得出来了,只是没标注EC50;
2、这个得出的EC50肯定不是我要的值,应该是某个地方出了问题,我再想想。
3、我要的置信区间,就是针对于EC50这个结果的可能区间,所以应该就是-14132~14155。这个也能看出有错误,抑制中浓度的还有可能落在负区间,负浓度是没有意义的。
最后,感谢您的帮忙,我再去研究研究,试试别的软件,SPSS19.0、SigmaPlot10.0、GraphPad Prism6。
好好学习,天天向上
6楼2013-05-13 08:48:58
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萜烯

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by zong7699 at 2013-05-13 08:48:58
十分感谢!
1、公式当中的X0其实就是EC50值。也就是其实我的8.0也得出来了,只是没标注EC50;
2、这个得出的EC50肯定不是我要的值,应该是某个地方出了问题,我再想想。
3、我要的置信区间,就是针对于EC50这个 ...

你好 我现在也是出现这个问题 里面的Xo就是半数致死量(半衰期之类的),但是跟实际差别的很多,不知道你后来解决了吗
想在单位混,要么装B,要么就装SB。
7楼2017-12-22 09:47:41
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萜烯

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by zong7699 at 2013-05-13 08:48:58
十分感谢!
1、公式当中的X0其实就是EC50值。也就是其实我的8.0也得出来了,只是没标注EC50;
2、这个得出的EC50肯定不是我要的值,应该是某个地方出了问题,我再想想。
3、我要的置信区间,就是针对于EC50这个 ...

你好 我现在也是出现这个问题 里面的Xo就是半数致死量(半衰期之类的),但是跟实际差别的很多,不知道你后来解决了吗
想在单位混,要么装B,要么就装SB。
8楼2017-12-22 09:47:54
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