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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 粗粒化工具求推荐
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Y224365

木虫 (小有名气)

[求助] 粗粒化工具求推荐 已有1人参与

粗粒化建模不知道怎么将全原子模型映射成对应的粗粒化结构，本人做的还生物蛋白体系，粒子数较多，用VMD分组建模的话可能比较麻烦，最近
看到有用Martini.py进行转化的，谁能够指导一二。
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1楼 2015-06-08 09:11:48
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polypro

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Y224365: 金币+10, ★有帮助 2015-06-09 14:26:19
建议可参考文献
J. Phys. Chem. B 2012, 116(10):3045
J. Phys. Chem. B 2013, 117(9):2615
J. Phys. Chem. B 2014, 118(35):10362
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泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
2楼2015-06-09 08:52:16
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Y224365

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by polypro at 2015-06-09 08:52:16
建议可参考文献
J. Phys. Chem. B 2012, 116(10):3045
J. Phys. Chem. B 2013, 117(9):2615
J. Phys. Chem. B 2014, 118(35):10362

好的，我看看，谢谢楼主。

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2015-06-09 12:11:28
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Y224365

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by polypro at 2015-06-09 08:52:16
建议可参考文献
J. Phys. Chem. B 2012, 116(10):3045
J. Phys. Chem. B 2013, 117(9):2615
J. Phys. Chem. B 2014, 118(35):10362

您也是做粗粒化的吗？
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4楼2015-06-09 14:26:43
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polypro

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Y224365 at 2015-06-09 14:26:43
您也是做粗粒化的吗？...

以前做过
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泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
5楼2015-06-09 15:32:16
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