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万木有灵

金虫 (小有名气)

[求助] 求教基因芯片方面的一些知识已有1人参与

1.我们在找基因芯片的时候,一般都是用cdna,为什么不用crna?
2.找探针的标准是要看探针与cdna的匹配值,还是直接看探针是不是针对目的基因的(一般会有注释说探针是针对于哪个基因的)?
3.为什么找到的探针与cdna并不是匹配的很好呢?差了不是一点点,是数据库没有更新的缘故吗?
4.怎么看基因芯片是单通道还是双通道呢?具体的区别是在哪里呢?(不要发百度得到的答案,已经看过了,希望大神们能够简单的讲一下

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dxh86412

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

1.因为rna不稳定,体外很容用分解  2.不是太理解你的问题,探针肯定是依照基因序列来设计的,一般在一块芯片上会有多组探针对应一个基因 3. 不知道你说的是什么类型的芯片,不好具体回答 4.一般现在常见的芯片分为两类,一类是通过原位杂交技术制造的,主要是affymatrix公司的芯片都为单通道,还有就是安捷伦的芯片,有单通道和多通道的,第二类是cDNA芯片,这类芯片现在已经很少用了,这类是双通道芯片。区别:单通道芯片一个芯片只上一个样品,双通道的芯片上两个样品,其中一个样品为对照,两种样品使用不同的染色方案,一般为红绿染色,所有双通道芯片,如果基因下调就显示绿色,基因上调显红色,如果没有变化则显示黄色~
2楼2015-06-22 02:39:36
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